{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[434.7925081095251, 1019.56512746762, 1, 0, 0.2989584524971278, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989584524971278, 0.0006696534993627756],
[434.6687925167806, 1019.846753927983, 1, 0, 0.2988409395686631, 0.00230060224524031, 0, -0.01415598134941687, 1, 0.2988409395686631, 0.0006695844139513497],
[434.7925081095251, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2989352708963183, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989352708963182, 0.0006695073752846877],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006697371983426318],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006695251951257926],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006694971126012648],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006695224734437833],
[434.5953877466868, 1019.762247830459, 0, 1, 0.298822914746291, 0, 0.0009806207301039994, 0.006033919507347848, 0.7011770852537089, 1, 0.0006696566966096031],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006697786287359109],
[434.6939877838554, 1019.66364779329, 0, 1, 0.2988907110260758, 0, 0.0009807155547460723, 0.006034502978857288, 0.7011092889739242, 1, 0.0006694933608248648],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006697797300320409],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006695366323748978],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006698304499587595],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006693367574998366],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.000669779729878208],
[434.7925081095251, 1019.56512746762, 1, 0, 0.2989584524971277, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989584524971277, 0.0006694930055416787],
[434.3818787510922, 1019.975756826053, 0, 1, 0.2986761083553652, 0, 0.0009804154591985465, 0.006032656441941744, 0.7013238916446348, 1, 0.0006698608618660639],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006693315237523387],
[434.7498046002303, 1019.607830976915, 1, 0, 0.2989290900430448, 0.002300173546758784, 0, -0.01415334349764498, 1, 0.2989290900430448, 0.0006695213801768897],
[434.6797267102575, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989121934381107, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010878065618893, 1, 0.0006697782336034249],
[434.6906609037343, 1019.58263570984, 1, 0, 0.2989057572025535, 0.002300486506705645, 0, -0.01415526919131065, 1, 0.2989057572025535, 0.0006697630073760117],
[434.8144078652647, 1019.47533406477, 0, 1, 0.2989874681287433, 0, 0.000980896708910926, 0.006035617650019738, 0.7010125318712567, 1, 0.000669602637292253],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006695178241976934],
[434.5953877466868, 1019.762247830459, 0, 1, 0.2988229147462911, 0, 0.0009806207301039994, 0.006033919507347848, 0.7011770852537089, 1, 0.0006697176549726368],
[435.5441339096274, 1019.331090791364, 1.5, 5.5, 0.2993687200901653, 0.003443967862763686, 0.005395695323812836, 0.01200929782404457, 0.4896285314945966, 0.7931843741074367, 0.005079913604431973],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[435.1797267102575, 1019.177908866888, 0, 1, 0.2992246996644407, 0, 0.0009811829625622382, 0.00603737901548722, 0.7007753003355592, 1, 0.0006694425925487573],
[435.6402754988438, 1018.717360078302, 0, 1, 0.2995413678465441, 0, 0.0009816265425408447, 0.006040108435541086, 0.7004586321534558, 1, 0.0006701017401343959],
[435.5811266730889, 1018.776508904057, 1, 0, 0.2995006977772928, 0.002295783583732996, 0, -0.01412633133817837, 1, 0.2995006977772928, 0.0006695355957447979],
[435.5110487831161, 1018.846586794029, 1, 0, 0.2994525130060519, 0.002296152997252657, 0, -0.01412860439989747, 1, 0.2994525130060519, 0.0006697502063097369],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[435.5110487831161, 1018.722796619045, 0, 3, 0.2994780035962357, 0, 0.002944863911906607, 0.01812022860525647, 0.343767907064283, 1, 0.002013759403714778],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[435.0953877466868, 1019.262247830459, 0, 1, 0.2991667091389279, 0, 0.0009811017744731946, 0.006036879451915693, 0.7008332908610722, 1, 0.0006696262831312606],
[435.0668655994909, 1019.290769977655, 0, 1, 0.2991470976303841, 0, 0.0009810743209436915, 0.006036710525864949, 0.7008529023696159, 1, 0.0006699615556923589],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6512045630616, 1019.706431014084, 0, 0, 0.2988612937632601, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002719734792279157],
[434.0994241060037, 1017.270585244021, 0, 1.5, 0.2990963167968511, 0, 0.001474533935963737, 0.009073048128927889, 0.5867964979425255, 1, 0.0006703204100454709],
[434.6654656366595, 1019.692169940486, 0, 1, 0.298871099517532, 0, 0.0009806881228266809, 0.00603433418577709, 0.701128900482468, 1, 0.0003977058694842091],
[434.747620357368, 1019.610015219777, 0, 1, 0.2989275881821484, 0, 0.0009807671414295096, 0.006034820400145616, 0.7010724118178516, 1, 0.000670035671920415],
[434.6939877838553, 1019.66364779329, 1, 1, 0.2988907110260757, 0.00230046890019844, 0.0009807155547460723, -0.008120657876739037, 0.9106643428623269, 0.5084457649144782, 0.001339583512648785],
[434.8319593209387, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989855787076612, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010144212923388, 1, 0.0006695221754541128],
[435.0953877466868, 1019.262247830459, 0, 1, 0.2991667091389279, 0, 0.0009811017744731946, 0.006036879451915693, 0.7008332908610722, 1, 0.0006698220995738062],
[434.7925081095251, 1019.56512746762, 1, 0, 0.2989584524971278, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989584524971278, 0.0006695073744769428],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006698072786493108],
[434.8319593209387, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989855787076612, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010144212923388, 1, 0.0006701764488371286],
[434.6402754988438, 1019.717360078302, 0, 1, 0.2988537790612704, 0, 0.0009806638968304045, 0.006034185119265411, 0.7011462209387296, 1, 0.0006696989324476476],
[434.7925081095251, 1019.607830976915, 1, 0, 0.2989496746010342, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989496746010343, 0.0006694946730121046],
[434.729646140411, 1019.816948574068, 0, 1, 0.2988763974424252, 0, 0.0009805681317595508, 0.006033595861144092, 0.7011236025575748, 1, 0.0006696040264432623],
[434.792508109525, 1019.607830976915, 3, 0, 0.2989496746010342, 0.006899842899878795, 0, -0.04245586024558019, 1, 0.02671740384867693, 0.002010127925755035],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.3818787510922, 1019.975756826053, 0, 1, 0.2986761083553652, 0, 0.0009804154591985465, 0.006032656441941744, 0.7013238916446348, 1, 0.0006698072519345091],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006697819713626977],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481333, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006697908161326893],
[434.5218158426388, 1019.866868004222, 0, 1, 0.2987659493425979, 0, 0.0009805201358848931, 0.006033300534688636, 0.7012340506574021, 1, 0.0006696566966096031],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.4431551360055, 1019.91448044114, 0, 1, 0.2987182413104337, 0, 0.0009804743624852485, 0.006033018883484909, 0.7012817586895663, 1, 0.0006701988011321488],
[434.5953877466868, 1019.762247830459, 0, 1, 0.2988229147462911, 0, 0.0009806207301039994, 0.006033919507347848, 0.7011770852537089, 1, 0.0006695813958147455],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006698067504222069],
[434.6797267102575, 1019.717360078302, 0, 1, 0.298872797985363, 0, 0.0009806638968304045, 0.006034185119265411, 0.7011272020146371, 1, 0.0006697810664553463],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.000669698906492359],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006696566695859354],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006698206730439503],
[434.6797267102575, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989121934381107, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010878065618893, 1, 0.00066979084116633],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006694941252194082],
[435.1797267102575, 1018.873443645526, 0, 1, 0.2992873545358565, 0, 0.0009814761649121048, 0.006039183137431769, 0.7007126454641435, 1, 0.0006702669897609465],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.373443645526, 1, 0, 0.2989434881558687, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2989434881558688, 0.0006700311055655963],
[434.629807280104, 1018.962814287093, 0, 1, 0.2990038617639006, 0, 0.0009813900821293859, 0.006038653456010656, 0.7009961382360994, 1, 0.0006708238491051234],
[434.6797267102575, 1019.373443645526, 0, 1, 0.2989434881558687, 0, 0.0009809947534279082, 0.006036220933945364, 0.7010565118441312, 1, 0.0006718212515509302],
[434.8319593209387, 1019.221211034844, 0, 1, 0.2990481835093708, 0, 0.0009811412764699741, 0.006037122514153345, 0.7009518164906292, 1, 0.0006697826653891552],
[434.5417551731741, 1019.511415182609, 0, 2, 0.2988486006098723, 0, 0.001961723988781207, 0.01207080809181323, 0.4916132848667344, 1, 0.001341689149846661],
[434.6797267102575, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989121934381107, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010878065618893, 1, 0.0006696836875402646],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006698458272186161],
[434.7640656738282, 1019.593569903317, 0, 1, 0.2989388957973167, 0, 0.0009807829605033942, 0.0060349177374908, 0.7010611042026833, 1, 0.000669569283733087],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.000669679246053071],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006698705553930454],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006695693115406054],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006700061202370634],
[434.3818787510922, 1019.975756826053, 0, 1, 0.2986761083553652, 0, 0.0009804154591985465, 0.006032656441941744, 0.7013238916446348, 1, 0.0006697916570889873],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006698072519345091],
[434.6797267102575, 1019.638457655474, 0, 1, 0.2988890129980966, 0, 0.0009807397832947275, 0.00603465206107417, 0.7011109870019034, 1, 0.0006696233569447986],
[434.9946601503597, 1019.515208037467, 1, 0, 0.2990661456923077, 0.002298878794637022, 0, -0.01414537667638081, 1, 0.2990661456923076, 0.00066950740207852],
[434.6797267102575, 1019.638457655474, 0, 1, 0.2988890129980966, 0, 0.0009807397832947275, 0.00603465206107417, 0.7011109870019034, 1, 0.0006698072786493108],
[434.6797267102575, 1019.652718729072, 0, 1, 0.2988860821151164, 0, 0.0009807260664654845, 0.006034567659183605, 0.7011139178848836, 1, 0.0006697810664553463],
[434.5669453109899, 1019.747986756861, 1, 0, 0.2988121319039825, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988121319039825, 0.0006697908410865345],
[434.8818787510921, 1019.475756826053, 0, 1, 0.299019902748002, 0, 0.0009808963021477946, 0.006035615147139758, 0.7009800972519979, 1, 0.000669569283733087],
[434.392812944569, 1020.032716279687, 0, 1, 0.2986696838141037, 0, 0.0009803607120046588, 0.006032319573516439, 0.7013303161858964, 1, 0.0006698197627314308],
[434.7191779216711, 1019.638457655474, 0, 1, 0.2989080314823374, 0, 0.0009807397832947275, 0.00603465206107417, 0.7010919685176626, 1, 0.0006696436762541233],
[434.5274940995762, 1019.830141477569, 0, 1, 0.2987762318359465, 0, 0.0009805554467640675, 0.00603351780829517, 0.7012237681640534, 1, 0.0006698075680891531],
[434.7925081095251, 1019.607830976915, 1, 0, 0.2989496746010342, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989496746010343, 0.0006695221753746003],
[434.5274940995763, 1019.830141477569, 0, 1, 0.2987762318359465, 0, 0.0009805554467640675, 0.00603351780829517, 0.7012237681640534, 1, 0.0006698206730359561],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006697910681741328],
[434.6797267102575, 1019.717360078302, 0, 1, 0.298872797985363, 0, 0.0009806638968304045, 0.006034185119265411, 0.7011272020146371, 1, 0.000669521439573311],
[434.392812944569, 1020.032716279687, 0, 1, 0.2986696838141037, 0, 0.0009803607120046588, 0.006032319573516439, 0.7013303161858963, 1, 0.0006698197624728308],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006697916570889873],
[435.1402754988438, 1019.217360078302, 0, 1, 0.2991975734539072, 0, 0.0009811449835618721, 0.006037145324495235, 0.7008024265460928, 1, 0.0006708463595831751],
[434.8319593209387, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989855787076612, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010144212923388, 1, 0.0006696436762266104],
[434.5953877466868, 1019.762247830459, 0, 1, 0.298822914746291, 0, 0.0009806207301039994, 0.006033919507347848, 0.7011770852537089, 1, 0.0006698072525569165],
[435.0953877466868, 1019.262247830459, 0, 1, 0.2991667091389279, 0, 0.0009811017744731946, 0.006036879451915693, 0.7008332908610722, 1, 0.0006698201684981099],
[434.5669453109899, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988265312148289, 0.002301141425481333, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988265312148288, 0.00066979084116633],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006695214389939737],
[434.747620357368, 1019.610015219777, 0, 1, 0.2989275881821484, 0, 0.0009807671414295096, 0.006034820400145616, 0.7010724118178516, 1, 0.0006698221003160694],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.00066979084116633],
[434.7191779216711, 1019.638457655474, 0, 1, 0.2989080314823374, 0, 0.0009807397832947275, 0.00603465206107417, 0.7010919685176626, 1, 0.0006695221754541128],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006698221003160694],
[434.792508109525, 1019.56512746762, 1, 0, 0.2989584524971278, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989584524971278, 0.0006695084580498871],
[434.5274940995762, 1019.830141477569, 0, 1, 0.2987762318359465, 0, 0.0009805554467640675, 0.00603351780829517, 0.7012237681640534, 1, 0.0006696566966096031],
[435.0953877466868, 1019.262247830459, 0, 1, 0.2991667091389279, 0, 0.0009811017744731946, 0.006036879451915693, 0.7008332908610722, 1, 0.0006698197624728308],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006697919091592352],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006695704209191022],
[434.6402754988438, 1019.717360078302, 0, 1, 0.2988537790612704, 0, 0.0009806638968304045, 0.006034185119265411, 0.7011462209387296, 1, 0.0006702734105244306],
[434.5274940995762, 1019.830141477569, 0, 1, 0.2987762318359465, 0, 0.0009805554467640675, 0.00603351780829517, 0.7012237681640534, 1, 0.00066979084116633],
[434.3647932701551, 1019.840609696309, 1, 0, 0.2986956260677379, 0.002302212369633847, 0, -0.01416588870777588, 1, 0.2986956260677379, 0.0006698072787285381],
[434.466640475946, 1019.702035963866, 0, 1, 0.2987732080295079, 0, 0.0009806786342784514, 0.006034275801190163, 0.7012267919704921, 1, 0.0006700061202370634],
[434.9070688889079, 1019.450566688237, 0, 1, 0.2990372232042636, 0, 0.0009809205396281017, 0.006035764284314554, 0.7009627767957364, 1, 0.0006696436762541233],
[434.6906609037343, 1019.58263570984, 1, 0, 0.2989057572025535, 0.002300486506705645, 0, -0.01415526919131065, 1, 0.2989057572025535, 0.0006696566695781354],
[435.0953877466868, 1019.262247830459, 0, 1, 0.2991667091389279, 0, 0.0009811017744731946, 0.006036879451915693, 0.7008332908610722, 1, 0.0006698206730439503],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.00066950740207852],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481333, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006698072787285381],
[434.5953877466868, 1019.762247830459, 0, 1, 0.2988229147462911, 0, 0.0009806207301039994, 0.006033919507347848, 0.7011770852537089, 1, 0.0006702436508757232],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.00066979084116633],
[434.9775746694228, 1019.380060907723, 0, 1, 0.2990857021882425, 0, 0.0009809883853422977, 0.006036181750074567, 0.7009142978117575, 1, 0.0006695693115406054],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006702436508771425],
[434.8253420587415, 1019.419512119136, 0, 1, 0.2990042156996729, 0, 0.000980950421403287, 0.006035948151757562, 0.7009957843003272, 1, 0.0006697908410865345],
[434.8253420587416, 1019.419512119136, 0, 1, 0.2990042156996729, 0, 0.000980950421403287, 0.006035948151757562, 0.7009957843003272, 1, 0.0006698072519345091],
[435.1402754988438, 1019.217360078302, 1, 0, 0.2991975734539072, 0.002298109497801835, 0, -0.01414064306731231, 1, 0.2991975734539072, 0.0006697819691486726],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481333, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006697908419380599],
[434.5669453109899, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988265312148289, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988265312148288, 0.000669807252549105],
[434.966640475946, 1019.323101454089, 0, 1, 0.2990921464512895, 0, 0.0009810432026640776, 0.006036519050008246, 0.7009078535487105, 1, 0.0006698099166767883],
[434.6402754988438, 1019.717360078302, 0, 1, 0.2988537790612704, 0, 0.0009806638968304045, 0.006034185119265411, 0.7011462209387296, 1, 0.0006696989065002095],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 0, 0.2988809052718039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001591547297117794],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0005105139707439198],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5110487831161, 1019.846586794029, 0, 0, 0.2987649242207782, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000159154734855846],
[434.5953877466868, 1019.762247830459, 0, 1, 0.2988229147462911, 0, 0.0009806207301039994, 0.006033919507347848, 0.7011770852537089, 1, 0.0005105139707171432],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 0, 0.2987258108211561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000159154734855846],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0005105139707171432],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 0, 0.2988809052718039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001617964509102786],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0005080458668683139],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.615812327458, 0, 0, 0.2988936671000712, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001617970710448672],
[434.6797267102575, 1019.646860597173, 0, 1, 0.2988872860497121, 0, 0.0009807317009874711, 0.006034602329317618, 0.701112713950288, 1, 0.000508045557935474],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 0, 0.2988809052718039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001591550378056721],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0005105137115352876],
[434.9052895087926, 1019.677908866888, 0, 0, 0.2989896280903335, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001602768829654657],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.792508109525, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2989352708963183, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989352708963183, 0.0005089896911188301],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 0, 0.2988809052718039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001591547348262645],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0005105139707171432],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6512045630616, 1019.706431014084, 0, 0, 0.2988612937632601, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001591547296576611],
[434.6654656366596, 1019.692169940486, 0, 1, 0.298871099517532, 0, 0.0009806881228266809, 0.00603433418577709, 0.701128900482468, 1, 0.0005105139707171432],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 0, 0.2988809052718039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001591547299193011],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0005105139705188493],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 0, 0.2987258108211561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001591547348577655],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0005105139707171432],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.706431014084, 0, 0, 0.2988750438813272, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001618263319583979],
[434.6797267102575, 1019.692169940486, 0, 1, 0.2988779745478282, 0, 0.0009806881228266809, 0.00603433418577709, 0.7011220254521718, 1, 0.0005075128783723522],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.599006444061, 0, 0, 0.298897121164277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001592144698711958],
[434.6797267102575, 1019.638457655474, 0, 1, 0.2988890129980966, 0, 0.0009807397832947275, 0.00603465206107417, 0.7011109870019034, 1, 0.0005104637250255802],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006700241176112537],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.000669693201962891],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006695629032835069],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 0, 0.2987258108211561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002630641185978112],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481333, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.000406522701624415],
[433.9712493926593, 1020.386386184486, 1, 0, 0.2983937642136026, 0.00230430011527145, 0, -0.01417873494765476, 1, 0.2983937642136026, 0.0006700645518923649],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.0840307919269, 1020.273604785218, 0, 0, 0.2984713114389265, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002726030402008082],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.3818787510922, 1019.975756826053, 0, 1, 0.2986761083553652, 0, 0.0009804154591985465, 0.006032656441941744, 0.7013238916446348, 1, 0.0003971574568669472],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5274940995763, 1019.830141477569, 0, 1, 0.2987762318359466, 0, 0.0009805554467640675, 0.00603351780829517, 0.7012237681640534, 1, 0.0006698537843692233],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[433.6838512778662, 1017.686158002105, 1.5, 0, 0.2988099853964998, 0.003458740729174472, 0, -0.02128219658828855, 1, 0.2251828018838574, 0.0006703166150777208],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.4841919316199, 1020.019997999269, 0, 1, 0.2987163563635141, 0, 0.0009803729357870064, 0.006032394788445613, 0.7012836436364859, 1, 0.001005250709358614],
[434.5341113617734, 1019.975756826053, 0, 2, 0.2987495106534817, 0, 0.001960830918397093, 0.01206531288388349, 0.4917522488087314, 1, 0.001004395965847998],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6687925167807, 1019.384377839002, 1, 0, 0.2989359683528109, 0.00230060224524031, 0, -0.01415598134941687, 1, 0.2989359683528109, 0.000669793580848032],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.373443645526, 0, 0, 0.2989434881558687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001769339968842337],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989121934381107, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010878065618893, 1, 0.0004926926680343863],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006697467110714519],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.0789559004766, 1020.311570309589, 0, 1, 0.2984610722345837, 0, 0.0009800927766570105, 0.006030670923563147, 0.7015389277654163, 1, 0.0006695665529149594],
[434.5789559004766, 1019.811570309589, 0, 1, 0.298804858852407, 0, 0.0009805733030626678, 0.006033627681016749, 0.701195141147593, 1, 0.0006695846137293565],
[434.466174501209, 1019.924351708857, 1, 0, 0.2987273133807917, 0.002301675156064923, 0, -0.01416258314494855, 1, 0.2987273133807917, 0.0006695914043735461],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5056257126226, 1019.952794144554, 0, 1, 0.298740493217599, 0, 0.000980437531757253, 0.006032792258000357, 0.701259506782401, 1, 0.0006695655810293771],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6687925167806, 1019.773182023935, 1, 0, 0.2988560562232401, 0.00230060224524031, 0, -0.01415598134941687, 1, 0.2988560562232401, 0.0006697068702853125],
[434.5274940995762, 1019.762247830459, 0, 1, 0.2987901802311421, 0, 0.0009806207301039994, 0.006033919507347848, 0.7012098197688579, 1, 0.0006695746821352883],
[434.7405803338878, 1019.774966110876, 0, 1, 0.2988902947077557, 0, 0.0009806085001416614, 0.006033844254392184, 0.7011097052922444, 1, 0.0006697155028482594],
[434.4826063474192, 1019.762247830459, 1, 1, 0.2987685361919629, 0.002301588108225405, 0.0009806207301039994, -0.008128128018027493, 0.9107373617817116, 0.5082744341656377, 0.001340442539175951],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481333, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006698072527107783],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006697522452128682],
[434.792508109525, 1019.56512746762, 1, 0, 0.2989584524971278, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989584524971278, 0.0006695076310369598],
[434.6096488202847, 1019.747986756861, 1, 0, 0.298832720500563, 0.002300915321862791, 0, -0.01415790776100668, 1, 0.298832720500563, 0.0006698072786493108],
[434.6402754988438, 1019.717360078302, 0, 1, 0.2988537790612704, 0, 0.0009806638968304045, 0.006034185119265411, 0.7011462209387296, 1, 0.000669703991836794],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006696773290156468],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 0, 0.2988809052718039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002536368900518319],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.00041579851379607],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 1, 0.2987258108211561, 0, 0.0009804849456655715, 0.006033084003521881, 0.7012741891788439, 1, 0.0006701121878529793],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 0, 0.2987258108211561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002724364781919264],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0003971298701826462],
[433.9712493926593, 1020.690851405849, 1, 0, 0.2983313094872269, 0.00230430011527145, 0, -0.01417873494765476, 1, 0.2983313094872269, 0.0006696775956489474],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.0840307919269, 1020.578070006581, 0, 0, 0.2984088404816796, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002771826961450616],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.3818787510921, 1020.127989436734, 0, 1, 0.2986448481730058, 0, 0.0009802691528463521, 0.006031756195061932, 0.7013551518269943, 1, 0.0003923554830989685],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[433.9152100438316, 1020.306638239093, 1, 0, 0.2983830909679826, 0.002304597711380032, 0, -0.01418056610511427, 1, 0.2983830909679825, 0.0006700693620505222],
[434.0279914430992, 1020.193856839825, 0, 0, 0.2984606454342429, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002493035264090298],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.3538590766784, 1019.935882853357, 1, 0, 0.2986707851629575, 0.002302270324305938, 0, -0.01416624531233841, 1, 0.2986707851629575, 0.0004204478256515923],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.3413825124547, 1020.016253064691, 1, 0, 0.2986482635958322, 0.002302336457593527, 0, -0.01416665224125784, 1, 0.2986482635958323, 0.0006700921669892675],
[434.4432297182454, 1019.9144058589, 1, 0, 0.2987182925923455, 0.002301796717257032, 0, -0.01416333113081697, 1, 0.2987182925923455, 0.0006697933266778684],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006698174951398878],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006699478846197709],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006698162471931702],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.4267895310443, 1019.930846046101, 1, 0, 0.2987069885039981, 0.002301883825073223, 0, -0.01416386711943645, 1, 0.2987069885039981, 0.000670186535293594],
[434.6096488202846, 1019.747986756861, 1, 0, 0.298832720500563, 0.002300915321862791, 0, -0.01415790776100668, 1, 0.298832720500563, 0.0006697671002826334],
[434.2624800896274, 1020.095155487518, 1, 0, 0.2985940111747654, 0.002302754775852636, 0, -0.0141692262218259, 1, 0.2985940111747654, 0.0006701877829828543],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5274940995762, 1019.830141477569, 0, 1, 0.2987762318359465, 0, 0.0009805554467640675, 0.00603351780829517, 0.7012237681640534, 1, 0.0006697667307973791],
[434.2624800896274, 1020.095155487518, 1, 0, 0.2985940111747654, 0.002302754775852636, 0, -0.0141692262218259, 1, 0.2985940111747654, 0.0006701331223910685],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5274940995763, 1019.830141477569, 0, 1, 0.2987762318359466, 0, 0.0009805554467640675, 0.00603351780829517, 0.7012237681640534, 1, 0.0006697646594631391],
[434.8714105323523, 1019.486225044793, 1, 0, 0.2990127049181946, 0.002299530334210381, 0, -0.01414938570578516, 1, 0.2990127049181946, 0.0006700278168700981],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.8319593209387, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989855787076612, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010144212923388, 1, 0.0006693914577876411],
[434.858176007958, 1019.273896770652, 1, 0, 0.2990499860009377, 0.002299600318384493, 0, -0.01414981632983829, 1, 0.2990499860009377, 0.0006700043831156079],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.8253420587415, 1019.419512119136, 0, 1, 0.2990042156996729, 0, 0.000980950421403287, 0.006035948151757562, 0.7009957843003272, 1, 0.0006697657113664371],
[433.8748366592762, 1017.607787142094, 1.25, 0.5, 0.29891838148429, 0.002881015201583655, 0.0004913484412341493, -0.01470400985690401, 0.958626342603372, 0.3626531447165193, 0.000670094325439801],
[434.1705770261549, 1020.187058550991, 1, 0, 0.2985308196589893, 0.002303242211504717, 0, -0.01417222549300116, 1, 0.2985308196589893, 0.000670913904002867],
[434.3413825124547, 1020.016253064691, 1, 0, 0.2986482635958322, 0.002302336457593527, 0, -0.01416665224125784, 1, 0.2986482635958323, 0.0006701959460287736],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 1, 0, 0.2987258108211561, 0.002301738786426253, 0, -0.01416297467295393, 1, 0.2987258108211561, 0.0006700060236641972],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 1, 0, 0.2987258108211561, 0.002301738786426253, 0, -0.01416297467295393, 1, 0.2987258108211561, 0.0006704381260020072],
[434.4399028381243, 1019.917732739021, 0, 1, 0.2987160050668842, 0, 0.0009804712359637758, 0.006032999645487663, 0.7012839949331158, 1, 0.0006699670332086961],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 1, 0, 0.2987258108211561, 0.002301738786426253, 0, -0.01416297467295393, 1, 0.2987258108211561, 0.0006841641503824496],
[434.7520118708875, 1019.953646722906, 0, 2, 0.2988590917362247, 0, 0.001960873424420774, 0.01206557443038928, 0.4915985732409519, 1, 0.001340897219819355],
[433.1664944727551, 1018.507592037767, 0.375, 1.375, 0.2983910083522838, 0.0008657179278292181, 0.001350014482708946, 0.00297995579750821, 0.687972405609002, 0.4621433954579447, 0.0006763128118962374],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 1, 0.2987258108211561, 0, 0.0009804849456655715, 0.006033084003521881, 0.7012741891788439, 1, 0.0006699796552276119],
[434.038502875293, 1020.319132701852, 0, 1, 0.2984400069540321, 0, 0.000980085512414095, 0.006030626225490092, 0.7015599930459679, 1, 0.0006704404669688798],
[435.1168647411433, 1019.701319624588, 0, 1, 0.2990867652172251, 0, 0.0009806793232043265, 0.006034280040263589, 0.7009132347827749, 1, 0.0006699509343205944],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 1, 0, 0.2987258108211561, 0.002301738786426253, 0, -0.01416297467295393, 1, 0.2987258108211561, 0.0006706410790566108],
[434.4684249853202, 1019.889210591825, 0, 1, 0.298735616575428, 0, 0.0009804986557507714, 0.006033168363915248, 0.701264383424572, 1, 0.0006698691962886233],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 1, 0.2987258108211561, 0, 0.0009804849456655715, 0.006033084003521881, 0.7012741891788439, 1, 0.0006699986069928172],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 1, 0.2987258108211561, 0, 0.0009804849456655715, 0.006033084003521881, 0.7012741891788439, 1, 0.0006700357069021928],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 1, 0.2987258108211561, 0, 0.0009804849456655715, 0.006033084003521881, 0.7012741891788439, 1, 0.0006700357317394197],
[434.3413825124546, 1019.903471665423, 1, 0, 0.2986714247361041, 0.002302336457593527, 0, -0.01416665224125784, 1, 0.2986714247361041, 0.000670034752373532],
[434.3840860217495, 1019.973549555396, 1, 0, 0.2986776260499152, 0.002302110119084635, 0, -0.01416525954344701, 1, 0.2986776260499151, 0.0006700357318945947],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.000669697175554488],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 1, 0.2987258108211561, 0, 0.0009804849456655715, 0.006033084003521881, 0.7012741891788439, 1, 0.0006700357319747973],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 1, 0, 0.2987258108211561, 0.002301738786426253, 0, -0.01416297467295393, 1, 0.2987258108211561, 0.0006698691961345248],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 1, 0.2987258108211561, 0, 0.0009804849456655715, 0.006033084003521881, 0.7012741891788439, 1, 0.0006700357324906964],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 1, 0, 0.2987258108211561, 0.002301738786426253, 0, -0.01416297467295393, 1, 0.2987258108211561, 0.0006697244530361225],
[434.3019313010411, 1020.055704276104, 0, 1, 0.2986211373852988, 0, 0.0009803386185754069, 0.006032183629037952, 0.7013788626147012, 1, 0.0006700633295511939],
[434.4650981051991, 1019.734626604328, 1, 0, 0.2987657683623771, 0.002301680858511367, 0, -0.01416261823303284, 1, 0.2987657683623771, 0.0006697804492586766],
[434.3413825124547, 1019.903471665423, 1, 0, 0.2986714247361041, 0.002302336457593527, 0, -0.01416665224125784, 1, 0.2986714247361041, 0.0006701180886945118],
[434.4432297182454, 1019.998744822471, 1, 0, 0.2987009707660795, 0.002301796717257032, 0, -0.01416333113081697, 1, 0.2987009707660795, 0.000669822243023347],
[434.13923047162, 1020.066172494844, 1, 0, 0.2985405153811217, 0.002303408514622525, 0, -0.01417324878324566, 1, 0.2985405153811217, 0.0006699443389638829],
[434.4147127003087, 1019.942922876837, 0, 1, 0.2986986846106227, 0, 0.0009804470206817202, 0.006032850644902334, 0.7013013153893773, 1, 0.0006699860324641797],
[434.2520118708876, 1020.105623706258, 0, 1, 0.298586813344958, 0, 0.0009802906451655369, 0.006031888440812002, 0.701413186655042, 1, 0.0006698968313916829],
[434.6139675316534, 1019.891229489872, 0.5, 1.5, 0.2988053727285661, 0.00115044622895969, 0.001470745072246839, 0.001970851093966076, 0.701194627271434, 0.5083260946856747, 0.001340624482275994],
[434.6063965224035, 1019.841763917556, 0, 2, 0.2988118850457608, 0, 0.001961088544086806, 0.01206689809682773, 0.4916647725530793, 1, 0.001340332142711436],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006697768294745321],
[434.4541639117223, 1019.44677383338, 0, 1, 0.2988196462583828, 0, 0.0009809241891459868, 0.006035786740394141, 0.7011803537416172, 1, 0.0006701442545931834],
[434.3840860217495, 1019.669084334033, 1, 0, 0.2987401663692001, 0.002302110119084635, 0, -0.01416525954344701, 1, 0.2987401663692002, 0.0006702740748597171],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.4541639117223, 1019.53111279695, 0, 1, 0.2988023131122611, 0, 0.0009808430438739931, 0.006035287440282914, 0.701197686887739, 1, 0.0006702075737566398],
[434.4541639117223, 1019.613267517659, 1, 0, 0.2987854307998936, 0.002301738786426253, 0, -0.01416297467295393, 1, 0.2987854307998936, 0.0006700423027491328],
[434.5669453109899, 1019.486225044793, 1, 0, 0.2988659246928765, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988659246928765, 0.0006698696885528253],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989121934381107, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010878065618893, 1, 0.0006697865222398044]
],
"NAMES": [
["epi_isl_414482_USA_20200218_null_1"],
["epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1"],
["epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1"],
["epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1"],
["epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1"],
["epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1"],
["epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1"],
["epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_419832_Northern_Territory_20200221_null_2"],
["epi_isl_420172_South_Yorkshire_20200324_null_2"],
["epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1"],
["epi_isl_420769_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1"],
["epi_isl_422345_Wales_20200324_null_5"],
["Node34"],
["epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1"],
["epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1"],
["epi_isl_420210_South_Yorkshire_20200327_null_1"],
["epi_isl_419400_Wales_20200316_null_1"],
["epi_isl_425615_England_20200329_null_3"],
["epi_isl_421589_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_423863_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_427621_Alaska_20200325_null_1"],
["epi_isl_422667_Netherlands_20200316_null_5"],
["epi_isl_422952_Zuid_Holland_20200327_null_1"],
["epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_423967_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1"],
["epi_isl_417438_Kinshasa_20200317_null_1"],
["epi_isl_418750_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_421665_India_20200310_null_1"],
["epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1"],
["epi_isl_421662_India_20200310_null_1"],
["epi_isl_427644_New_South_Wales_20200302_null_29"],
["Node400"],
["epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1"],
["epi_isl_425387_England_20200313_null_2"],
["Node410"],
["epi_isl_417288_England_20200305_null_1"],
["Node409"],
["epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1"],
["epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1"],
["epi_isl_421831_England_20200323_null_3"],
["epi_isl_426718_Victoria_20200325_null_1"],
["epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2"],
["epi_isl_427286_Minnesota_20200323_null_2"],
["epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1"],
["epi_isl_423509_England_20200331_null_6"],
["epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1"],
["epi_isl_420904_Munich_20200315_null_1"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_428206_Nebraska_20200325_null_8229"],
["epi_isl_422577_Netherlands_20200330_null_1"],
["epi_isl_418117_Wales_20200314_null_1"],
["epi_isl_423444_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_420451_Mons_20200307_null_1"],
["epi_isl_402130_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_426569_Arizona_20200402_null_14"],
["Node45"],
["epi_isl_421807_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_1"],
["epi_isl_426770_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_427063_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_424035_England_20200320_null_2"],
["epi_isl_426661_Victoria_20200321_null_2"],
["epi_isl_419225_Hong_Kong_20200213_null_1"],
["epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_1"],
["epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_28"],
["epi_isl_419244_Hong_Kong_20200222_null_1"],
["epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_1"],
["Node460"],
["epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1"],
["epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1"],
["Node454"],
["epi_isl_421847_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_426935_Victoria_20200329_null_1"],
["epi_isl_424579_Reykjavik_20200326_null_1"],
["epi_isl_426682_Victoria_20200322_null_2"],
["epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1"],
["epi_isl_425199_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1"],
["epi_isl_425941_Scotland_20200326_null_3"],
["epi_isl_422354_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_422899_Utrecht_20200303_null_1"],
["epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1"],
["epi_isl_422939_Zuid_Holland_20200324_null_3"],
["epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_3"],
["epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1"],
["epi_isl_423075_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1"],
["epi_isl_425208_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1"],
["epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1"],
["epi_isl_423969_England_20200320_null_3"],
["epi_isl_417391_New_South_Wales_20200308_null_1"],
["epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1"],
["epi_isl_424332_Washington_20200322_null_4"],
["epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1"],
["epi_isl_425755_Scotland_20200319_null_1"],
["epi_isl_427492_New_York_20200401_null_2"],
["epi_isl_423804_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_425643_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_422541_New_York_20200319_null_2"],
["epi_isl_419881_Victoria_20200319_null_1"],
["epi_isl_420756_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_422750_Netherlands_20200325_null_1"],
["epi_isl_420052_Ile_de_France_20200320_null_1"],
["epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_427570_New_York_20200315_null_1"],
["epi_isl_423505_England_20200330_null_3"],
["epi_isl_425683_Scotland_20200312_null_2"],
["epi_isl_425611_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_423210_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_426057_Idaho_20200321_null_1"],
["epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_4"],
["epi_isl_422633_Zuid_Holland_20200331_null_1"],
["epi_isl_424943_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_425291_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_422304_Wales_20200324_null_2"],
["epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_427635_New_York_20200405_null_1"],
["epi_isl_420518_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_1"],
["epi_isl_426044_New_York_20200306_null_1"],
["epi_isl_425259_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_425850_Scotland_20200315_null_1"],
["epi_isl_427611_New_York_20200316_null_1"],
["epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_1"],
["epi_isl_424280_Washington_20200323_null_4"],
["epi_isl_427629_New_York_20200330_null_6"],
["epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_1"],
["epi_isl_424328_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_420590_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_421851_England_20200327_null_1"],
["Node360"],
["epi_isl_423868_England_20200318_null_3"],
["epi_isl_423952_England_20200319_null_1"],
["Node357"],
["epi_isl_422767_Netherlands_20200327_null_1"],
["epi_isl_426291_New_York_20200308_null_1"],
["Node354"],
["epi_isl_423202_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423203_England_20200324_null_1"],
["Node351"],
["epi_isl_424156_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_427731_New_South_Wales_20200317_null_2"],
["Node348"],
["epi_isl_424025_England_20200320_null_3"],
["epi_isl_427369_Liege_20200407_null_5"],
["Node345"],
["epi_isl_424000_England_20200321_null_3"],
["epi_isl_424001_England_20200319_null_1"],
["Node342"],
["epi_isl_422190_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_425765_Scotland_20200313_null_4"],
["Node339"],
["epi_isl_423610_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423791_England_20200323_null_2"],
["Node336"],
["epi_isl_423716_England_20200323_null_4"],
["epi_isl_425764_Scotland_20200313_null_1"],
["Node333"],
["epi_isl_422165_Wales_20200330_null_2"],
["epi_isl_423999_England_20200321_null_2"],
["Node330"],
["epi_isl_421843_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_2"],
["Node316"],
["epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1"],
["epi_isl_422311_Wales_20200327_null_1"],
["Node310"],
["epi_isl_427416_Doha_20200323_null_1"],
["epi_isl_423181_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_421908_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_423449_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_413559_California_20200227_null_1"],
["epi_isl_426101_Washington_20200325_null_1"],
["Node224"],
["epi_isl_425504_England_20200318_null_4"],
["epi_isl_423687_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423757_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423906_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_424070_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_424125_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_424131_England_20200321_null_2"],
["epi_isl_417242_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_422436_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_421848_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_423900_England_20200318_null_6"],
["epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_58"],
["Node248"],
["epi_isl_424641_Li_ge_20200403_null_3"],
["epi_isl_427373_Liege_20200407_null_7"],
["Node252"],
["epi_isl_423559_England_20200401_null_1"],
["Node251"],
["epi_isl_423558_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1"],
["epi_isl_420915_Wales_20200313_null_1"],
["epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1"],
["epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_419737_Victoria_20200307_null_1"],
["epi_isl_420701_England_20200327_null_9"],
["Node269"],
["epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2"],
["epi_isl_418769_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_421917_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_420676_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_423784_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_423436_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_423719_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_426109_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_427234_Washington_20200329_null_2"],
["Node285"],
["epi_isl_423701_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1"],
["epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1"],
["epi_isl_427386_Liege_20200408_null_4"],
["Node295"],
["epi_isl_424060_England_20200307_null_1"],
["Node294"],
["epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1"],
["epi_isl_423770_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_423814_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423833_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423855_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_418417_ARA_20200316_null_1"],
["epi_isl_420742_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_420720_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1"],
["epi_isl_414522_England_20200228_null_1"],
["Node323"],
["epi_isl_427029_Victoria_20200330_null_7"],
["Node322"],
["epi_isl_421666_India_20200310_null_4"],
["Node321"],
["epi_isl_427148_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1"],
["epi_isl_421834_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_425263_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_424613_Reykjavik_20200327_null_1"],
["epi_isl_427007_Victoria_20200329_null_6"],
["epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_2"],
["epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_2"],
["epi_isl_426815_Victoria_20200325_null_1"],
["epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_8"],
["Node186"],
["epi_isl_426786_Victoria_20200323_null_4"],
["Node185"],
["epi_isl_426699_Victoria_20200324_null_1"],
["epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_20"],
["Node193"],
["epi_isl_423362_England_20200328_null_1"],
["Node192"],
["epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1"],
["epi_isl_423917_England_20200318_null_7"],
["Node180"],
["epi_isl_423702_England_20200323_null_3"],
["Node179"],
["epi_isl_418388_Finland_20200313_null_2"],
["epi_isl_419856_Victoria_20200318_null_1"],
["Node175"],
["epi_isl_420775_England_20200330_null_1"],
["Node174"],
["epi_isl_420536_Western_Australia_20200315_null_2"],
["epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1"],
["epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_425767_Scotland_20200313_null_1"],
["Node168"],
["epi_isl_414619_USA_20200307_null_1"],
["epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1"],
["Node165"],
["epi_isl_413616_USA_20200217_null_1"],
["epi_isl_426673_Victoria_20200322_null_2"],
["Node162"],
["epi_isl_418870_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_426161_Wisconsin_20200406_null_4"],
["Node159"],
["epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2"],
["epi_isl_426929_Victoria_20200328_null_1"],
["Node156"],
["epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1"],
["epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_1"],
["Node153"],
["epi_isl_405839_Guangdong_20200111_null_1"],
["epi_isl_423675_England_20200320_null_3"],
["Node150"],
["epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1"],
["epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2"],
["epi_isl_420628_Virginia_20200313_null_1"],
["epi_isl_427265_Washington_20200331_null_13"],
["epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1"],
["epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1"],
["epi_isl_427774_New_South_Wales_20200322_null_1012"],
["epi_isl_413695_China_20200101_null_1"],
["epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1"],
["epi_isl_413752_China_20200201_null_1"],
["epi_isl_426421_Hawaii_20200307_null_1"],
["epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1"],
["epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_427777_New_South_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1"],
["epi_isl_418046_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_421286_Wisconsin_20200325_null_2"],
["epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_1"],
["epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_1"],
["epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2"],
["epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_14"],
["epi_isl_419709_BasqueCountry_20200304_null_1"],
["epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1"],
["epi_isl_424982_Michigan_20200310_null_2"],
["epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_15"],
["epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_418952_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_1"],
["epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2"],
["epi_isl_415600_USA_20200309_null_1"],
["epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_1"],
["epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2"],
["epi_isl_421243_Jiangxi_20200121_null_1"],
["epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1"],
["Node71"],
["epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_418265_Athens_20200318_null_1"],
["epi_isl_427806_New_South_Wales_20200326_null_164"],
["epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1"],
["epi_isl_427684_New_South_Wales_20200323_null_1"],
["Node139"],
["epi_isl_419238_Basque_Country_20200305_null_1"],
["Node138"]
],
"RESOLVED": [
[434.7925081095251, 1019.56512746762, 1, 0, 0.2989584524971278, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989584524971278, 0.0006696534993627756],
[434.6687925167806, 1019.846753927983, 1, 0, 0.2988409395686631, 0.00230060224524031, 0, -0.01415598134941687, 1, 0.2988409395686631, 0.0006695844139513497],
[434.7925081095251, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2989352708963183, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989352708963182, 0.0006695073752846877],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006697371983426318],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006695251951257926],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006694971126012648],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006695224734437833],
[434.5953877466868, 1019.762247830459, 0, 1, 0.298822914746291, 0, 0.0009806207301039994, 0.006033919507347848, 0.7011770852537089, 1, 0.0006696566966096031],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006697786287359109],
[434.6939877838554, 1019.66364779329, 0, 1, 0.2988907110260758, 0, 0.0009807155547460723, 0.006034502978857288, 0.7011092889739242, 1, 0.0006694933608248648],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006697797300320409],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006695366323748978],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006698304499587595],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006693367574998366],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.000669779729878208],
[434.7925081095251, 1019.56512746762, 1, 0, 0.2989584524971277, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989584524971277, 0.0006694930055416787],
[434.3818787510922, 1019.975756826053, 0, 1, 0.2986761083553652, 0, 0.0009804154591985465, 0.006032656441941744, 0.7013238916446348, 1, 0.0006698608618660639],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006693315237523387],
[434.7498046002303, 1019.607830976915, 1, 0, 0.2989290900430448, 0.002300173546758784, 0, -0.01415334349764498, 1, 0.2989290900430448, 0.0006695213801768897],
[434.6797267102575, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989121934381107, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010878065618893, 1, 0.0006697782336034249],
[434.6906609037343, 1019.58263570984, 1, 0, 0.2989057572025535, 0.002300486506705645, 0, -0.01415526919131065, 1, 0.2989057572025535, 0.0006697630073760117],
[434.8144078652647, 1019.47533406477, 0, 1, 0.2989874681287433, 0, 0.000980896708910926, 0.006035617650019738, 0.7010125318712567, 1, 0.000669602637292253],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006695178241976934],
[434.5953877466868, 1019.762247830459, 0, 1, 0.2988229147462911, 0, 0.0009806207301039994, 0.006033919507347848, 0.7011770852537089, 1, 0.0006697176549726368],
[435.5441339096274, 1019.331090791364, 1.5, 5.5, 0.2993687200901653, 0.003443967862763686, 0.005395695323812836, 0.01200929782404457, 0.4896285314945966, 0.7931843741074367, 0.005079913604431973],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[435.1797267102575, 1019.177908866888, 0, 1, 0.2992246996644407, 0, 0.0009811829625622382, 0.00603737901548722, 0.7007753003355592, 1, 0.0006694425925487573],
[435.6402754988438, 1018.717360078302, 0, 1, 0.2995413678465441, 0, 0.0009816265425408447, 0.006040108435541086, 0.7004586321534558, 1, 0.0006701017401343959],
[435.5811266730889, 1018.776508904057, 1, 0, 0.2995006977772928, 0.002295783583732996, 0, -0.01412633133817837, 1, 0.2995006977772928, 0.0006695355957447979],
[435.5110487831161, 1018.846586794029, 1, 0, 0.2994525130060519, 0.002296152997252657, 0, -0.01412860439989747, 1, 0.2994525130060519, 0.0006697502063097369],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[435.5110487831161, 1018.722796619045, 0, 3, 0.2994780035962357, 0, 0.002944863911906607, 0.01812022860525647, 0.343767907064283, 1, 0.002013759403714778],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[435.0953877466868, 1019.262247830459, 0, 1, 0.2991667091389279, 0, 0.0009811017744731946, 0.006036879451915693, 0.7008332908610722, 1, 0.0006696262831312606],
[435.0668655994909, 1019.290769977655, 0, 1, 0.2991470976303841, 0, 0.0009810743209436915, 0.006036710525864949, 0.7008529023696159, 1, 0.0006699615556923589],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6512045630616, 1019.706431014084, 0, 0, 0.2988612937632601, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002719734792279157],
[434.0994535165513, 1017.270555833474, 0, 2, 0.2990963370608413, 0, 0.001966045304792443, 0.01209739785498788, 0.4912659447215298, 1, 0.0006703204100454709],
[434.6654656366595, 1019.692169940486, 0, 1, 0.298871099517532, 0, 0.0009806881228266809, 0.00603433418577709, 0.701128900482468, 1, 0.0003977058694842091],
[434.747620357368, 1019.610015219777, 0, 1, 0.2989275881821484, 0, 0.0009807671414295096, 0.006034820400145616, 0.7010724118178516, 1, 0.000670035671920415],
[434.6939877838553, 1019.66364779329, 1, 1, 0.2988907110260757, 0.00230046890019844, 0.0009807155547460723, -0.008120657876739037, 0.9106643428623269, 0.5084457649144782, 0.001339583512648785],
[434.8319593209387, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989855787076612, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010144212923388, 1, 0.0006695221754541128],
[435.0953877466868, 1019.262247830459, 0, 1, 0.2991667091389279, 0, 0.0009811017744731946, 0.006036879451915693, 0.7008332908610722, 1, 0.0006698220995738062],
[434.7925081095251, 1019.56512746762, 1, 0, 0.2989584524971278, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989584524971278, 0.0006695073744769428],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006698072786493108],
[434.8319593209387, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989855787076612, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010144212923388, 1, 0.0006701764488371286],
[434.6402754988438, 1019.717360078302, 0, 1, 0.2988537790612704, 0, 0.0009806638968304045, 0.006034185119265411, 0.7011462209387296, 1, 0.0006696989324476476],
[434.7925081095251, 1019.607830976915, 1, 0, 0.2989496746010342, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989496746010343, 0.0006694946730121046],
[434.729646140411, 1019.816948574068, 0, 1, 0.2988763974424252, 0, 0.0009805681317595508, 0.006033595861144092, 0.7011236025575748, 1, 0.0006696040264432623],
[434.792508109525, 1019.607830976915, 3, 0, 0.2989496746010342, 0.006899842899878795, 0, -0.04245586024558019, 1, 0.02671740384867693, 0.002010127925755035],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.3818787510922, 1019.975756826053, 0, 1, 0.2986761083553652, 0, 0.0009804154591985465, 0.006032656441941744, 0.7013238916446348, 1, 0.0006698072519345091],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006697819713626977],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481333, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006697908161326893],
[434.5218158426388, 1019.866868004222, 0, 1, 0.2987659493425979, 0, 0.0009805201358848931, 0.006033300534688636, 0.7012340506574021, 1, 0.0006696566966096031],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.4431551360055, 1019.91448044114, 0, 1, 0.2987182413104337, 0, 0.0009804743624852485, 0.006033018883484909, 0.7012817586895663, 1, 0.0006701988011321488],
[434.5953877466868, 1019.762247830459, 0, 1, 0.2988229147462911, 0, 0.0009806207301039994, 0.006033919507347848, 0.7011770852537089, 1, 0.0006695813958147455],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006698067504222069],
[434.6797267102575, 1019.717360078302, 0, 1, 0.298872797985363, 0, 0.0009806638968304045, 0.006034185119265411, 0.7011272020146371, 1, 0.0006697810664553463],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.000669698906492359],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006696566695859354],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006698206730439503],
[434.6797267102575, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989121934381107, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010878065618893, 1, 0.00066979084116633],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006694941252194082],
[435.1797267102575, 1018.873443645526, 0, 1, 0.2992873545358565, 0, 0.0009814761649121048, 0.006039183137431769, 0.7007126454641435, 1, 0.0006702669897609465],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.373443645526, 1, 0, 0.2989434881558687, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2989434881558688, 0.0006700311055655963],
[434.629807280104, 1018.962814287093, 0, 1, 0.2990038617639006, 0, 0.0009813900821293859, 0.006038653456010656, 0.7009961382360994, 1, 0.0006708238491051234],
[434.6797267102575, 1019.373443645526, 0, 1, 0.2989434881558687, 0, 0.0009809947534279082, 0.006036220933945364, 0.7010565118441312, 1, 0.0006718212515509302],
[434.8319593209387, 1019.221211034844, 0, 1, 0.2990481835093708, 0, 0.0009811412764699741, 0.006037122514153345, 0.7009518164906292, 1, 0.0006697826653891552],
[434.5417551731741, 1019.511415182609, 0, 2, 0.2988486006098723, 0, 0.001961723988781207, 0.01207080809181323, 0.4916132848667344, 1, 0.001341689149846661],
[434.6797267102575, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989121934381107, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010878065618893, 1, 0.0006696836875402646],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006698458272186161],
[434.7640656738282, 1019.593569903317, 0, 1, 0.2989388957973167, 0, 0.0009807829605033942, 0.0060349177374908, 0.7010611042026833, 1, 0.000669569283733087],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.000669679246053071],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006698705553930454],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006695693115406054],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006700061202370634],
[434.3818787510922, 1019.975756826053, 0, 1, 0.2986761083553652, 0, 0.0009804154591985465, 0.006032656441941744, 0.7013238916446348, 1, 0.0006697916570889873],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006698072519345091],
[434.6797267102575, 1019.638457655474, 0, 1, 0.2988890129980966, 0, 0.0009807397832947275, 0.00603465206107417, 0.7011109870019034, 1, 0.0006696233569447986],
[434.9946601503597, 1019.515208037467, 1, 0, 0.2990661456923077, 0.002298878794637022, 0, -0.01414537667638081, 1, 0.2990661456923076, 0.00066950740207852],
[434.6797267102575, 1019.638457655474, 0, 1, 0.2988890129980966, 0, 0.0009807397832947275, 0.00603465206107417, 0.7011109870019034, 1, 0.0006698072786493108],
[434.6797267102575, 1019.652718729072, 0, 1, 0.2988860821151164, 0, 0.0009807260664654845, 0.006034567659183605, 0.7011139178848836, 1, 0.0006697810664553463],
[434.5669453109899, 1019.747986756861, 1, 0, 0.2988121319039825, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988121319039825, 0.0006697908410865345],
[434.8818787510921, 1019.475756826053, 0, 1, 0.299019902748002, 0, 0.0009808963021477946, 0.006035615147139758, 0.7009800972519979, 1, 0.000669569283733087],
[434.392812944569, 1020.032716279687, 0, 1, 0.2986696838141037, 0, 0.0009803607120046588, 0.006032319573516439, 0.7013303161858964, 1, 0.0006698197627314308],
[434.7191779216711, 1019.638457655474, 0, 1, 0.2989080314823374, 0, 0.0009807397832947275, 0.00603465206107417, 0.7010919685176626, 1, 0.0006696436762541233],
[434.5274940995762, 1019.830141477569, 0, 1, 0.2987762318359465, 0, 0.0009805554467640675, 0.00603351780829517, 0.7012237681640534, 1, 0.0006698075680891531],
[434.7925081095251, 1019.607830976915, 1, 0, 0.2989496746010342, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989496746010343, 0.0006695221753746003],
[434.5274940995763, 1019.830141477569, 0, 1, 0.2987762318359465, 0, 0.0009805554467640675, 0.00603351780829517, 0.7012237681640534, 1, 0.0006698206730359561],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006697910681741328],
[434.6797267102575, 1019.717360078302, 0, 1, 0.298872797985363, 0, 0.0009806638968304045, 0.006034185119265411, 0.7011272020146371, 1, 0.000669521439573311],
[434.392812944569, 1020.032716279687, 0, 1, 0.2986696838141037, 0, 0.0009803607120046588, 0.006032319573516439, 0.7013303161858963, 1, 0.0006698197624728308],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006697916570889873],
[435.1402754988438, 1019.217360078302, 0, 1, 0.2991975734539072, 0, 0.0009811449835618721, 0.006037145324495235, 0.7008024265460928, 1, 0.0006708463595831751],
[434.8319593209387, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989855787076612, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010144212923388, 1, 0.0006696436762266104],
[434.5953877466868, 1019.762247830459, 0, 1, 0.298822914746291, 0, 0.0009806207301039994, 0.006033919507347848, 0.7011770852537089, 1, 0.0006698072525569165],
[435.0953877466868, 1019.262247830459, 0, 1, 0.2991667091389279, 0, 0.0009811017744731946, 0.006036879451915693, 0.7008332908610722, 1, 0.0006698201684981099],
[434.5669453109899, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988265312148289, 0.002301141425481333, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988265312148288, 0.00066979084116633],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006695214389939737],
[434.747620357368, 1019.610015219777, 0, 1, 0.2989275881821484, 0, 0.0009807671414295096, 0.006034820400145616, 0.7010724118178516, 1, 0.0006698221003160694],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.00066979084116633],
[434.7191779216711, 1019.638457655474, 0, 1, 0.2989080314823374, 0, 0.0009807397832947275, 0.00603465206107417, 0.7010919685176626, 1, 0.0006695221754541128],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006698221003160694],
[434.792508109525, 1019.56512746762, 1, 0, 0.2989584524971278, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989584524971278, 0.0006695084580498871],
[434.5274940995762, 1019.830141477569, 0, 1, 0.2987762318359465, 0, 0.0009805554467640675, 0.00603351780829517, 0.7012237681640534, 1, 0.0006696566966096031],
[435.0953877466868, 1019.262247830459, 0, 1, 0.2991667091389279, 0, 0.0009811017744731946, 0.006036879451915693, 0.7008332908610722, 1, 0.0006698197624728308],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006697919091592352],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006695704209191022],
[434.6402754988438, 1019.717360078302, 0, 1, 0.2988537790612704, 0, 0.0009806638968304045, 0.006034185119265411, 0.7011462209387296, 1, 0.0006702734105244306],
[434.5274940995762, 1019.830141477569, 0, 1, 0.2987762318359465, 0, 0.0009805554467640675, 0.00603351780829517, 0.7012237681640534, 1, 0.00066979084116633],
[434.3647932701551, 1019.840609696309, 1, 0, 0.2986956260677379, 0.002302212369633847, 0, -0.01416588870777588, 1, 0.2986956260677379, 0.0006698072787285381],
[434.466640475946, 1019.702035963866, 0, 1, 0.2987732080295079, 0, 0.0009806786342784514, 0.006034275801190163, 0.7012267919704921, 1, 0.0006700061202370634],
[434.9070688889079, 1019.450566688237, 0, 1, 0.2990372232042636, 0, 0.0009809205396281017, 0.006035764284314554, 0.7009627767957364, 1, 0.0006696436762541233],
[434.6906609037343, 1019.58263570984, 1, 0, 0.2989057572025535, 0.002300486506705645, 0, -0.01415526919131065, 1, 0.2989057572025535, 0.0006696566695781354],
[435.0953877466868, 1019.262247830459, 0, 1, 0.2991667091389279, 0, 0.0009811017744731946, 0.006036879451915693, 0.7008332908610722, 1, 0.0006698206730439503],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.00066950740207852],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481333, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006698072787285381],
[434.5953877466868, 1019.762247830459, 0, 1, 0.2988229147462911, 0, 0.0009806207301039994, 0.006033919507347848, 0.7011770852537089, 1, 0.0006702436508757232],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.00066979084116633],
[434.9775746694228, 1019.380060907723, 0, 1, 0.2990857021882425, 0, 0.0009809883853422977, 0.006036181750074567, 0.7009142978117575, 1, 0.0006695693115406054],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006702436508771425],
[434.8253420587415, 1019.419512119136, 0, 1, 0.2990042156996729, 0, 0.000980950421403287, 0.006035948151757562, 0.7009957843003272, 1, 0.0006697908410865345],
[434.8253420587416, 1019.419512119136, 0, 1, 0.2990042156996729, 0, 0.000980950421403287, 0.006035948151757562, 0.7009957843003272, 1, 0.0006698072519345091],
[435.1402754988438, 1019.217360078302, 1, 0, 0.2991975734539072, 0.002298109497801835, 0, -0.01414064306731231, 1, 0.2991975734539072, 0.0006697819691486726],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481333, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006697908419380599],
[434.5669453109899, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988265312148289, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988265312148288, 0.000669807252549105],
[434.966640475946, 1019.323101454089, 0, 1, 0.2990921464512895, 0, 0.0009810432026640776, 0.006036519050008246, 0.7009078535487105, 1, 0.0006698099166767883],
[434.6402754988438, 1019.717360078302, 0, 1, 0.2988537790612704, 0, 0.0009806638968304045, 0.006034185119265411, 0.7011462209387296, 1, 0.0006696989065002095],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 0, 0.2988809052718039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001591547297117794],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0005105139707439198],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5110487831161, 1019.846586794029, 0, 0, 0.2987649242207782, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000159154734855846],
[434.5953877466868, 1019.762247830459, 0, 1, 0.2988229147462911, 0, 0.0009806207301039994, 0.006033919507347848, 0.7011770852537089, 1, 0.0005105139707171432],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 0, 0.2987258108211561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000159154734855846],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0005105139707171432],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 0, 0.2988809052718039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001617964509102786],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0005080458668683139],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.615812327458, 0, 0, 0.2988936671000712, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001617970710448672],
[434.6797267102575, 1019.646860597173, 0, 1, 0.2988872860497121, 0, 0.0009807317009874711, 0.006034602329317618, 0.701112713950288, 1, 0.000508045557935474],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 0, 0.2988809052718039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001591550378056721],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0005105137115352876],
[434.9052895087926, 1019.677908866888, 0, 0, 0.2989896280903335, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001602768829654657],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.792508109525, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2989352708963183, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989352708963183, 0.0005089896911188301],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 0, 0.2988809052718039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001591547348262645],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0005105139707171432],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6512045630616, 1019.706431014084, 0, 0, 0.2988612937632601, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001591547296576611],
[434.6654656366596, 1019.692169940486, 0, 1, 0.298871099517532, 0, 0.0009806881228266809, 0.00603433418577709, 0.701128900482468, 1, 0.0005105139707171432],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 0, 0.2988809052718039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001591547299193011],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0005105139705188493],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 0, 0.2987258108211561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001591547348577655],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0005105139707171432],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.706431014084, 0, 0, 0.2988750438813272, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001618263319583979],
[434.6797267102575, 1019.692169940486, 0, 1, 0.2988779745478282, 0, 0.0009806881228266809, 0.00603433418577709, 0.7011220254521718, 1, 0.0005075128783723522],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.599006444061, 0, 0, 0.298897121164277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001592144698711958],
[434.6797267102575, 1019.638457655474, 0, 1, 0.2988890129980966, 0, 0.0009807397832947275, 0.00603465206107417, 0.7011109870019034, 1, 0.0005104637250255802],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006700241176112537],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.000669693201962891],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006695629032835069],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 0, 0.2987258108211561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002630641185978112],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481333, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.000406522701624415],
[433.9712493926593, 1020.386386184486, 1, 0, 0.2983937642136026, 0.00230430011527145, 0, -0.01417873494765476, 1, 0.2983937642136026, 0.0006700645518923649],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.0840307919269, 1020.273604785218, 0, 0, 0.2984713114389265, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002726030402008082],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.3818787510922, 1019.975756826053, 0, 1, 0.2986761083553652, 0, 0.0009804154591985465, 0.006032656441941744, 0.7013238916446348, 1, 0.0003971574568669472],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5274940995763, 1019.830141477569, 0, 1, 0.2987762318359466, 0, 0.0009805554467640675, 0.00603351780829517, 0.7012237681640534, 1, 0.0006698537843692233],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[433.6838512778662, 1017.686158002105, 1, 0, 0.2988099853964998, 0.002305827152782981, 0, -0.01418813105885904, 1, 0.2988099853964998, 0.0006703166150777208],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.4841919316199, 1020.019997999269, 0, 1, 0.2987163563635141, 0, 0.0009803729357870064, 0.006032394788445613, 0.7012836436364859, 1, 0.001005250709358614],
[434.5341113617734, 1019.975756826053, 0, 2, 0.2987495106534817, 0, 0.001960830918397093, 0.01206531288388349, 0.4917522488087314, 1, 0.001004395965847998],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6687925167807, 1019.384377839002, 1, 0, 0.2989359683528109, 0.00230060224524031, 0, -0.01415598134941687, 1, 0.2989359683528109, 0.000669793580848032],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.373443645526, 0, 0, 0.2989434881558687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001769339968842337],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989121934381107, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010878065618893, 1, 0.0004926926680343863],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006697467110714519],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.0789559004766, 1020.311570309589, 0, 1, 0.2984610722345837, 0, 0.0009800927766570105, 0.006030670923563147, 0.7015389277654163, 1, 0.0006695665529149594],
[434.5789559004766, 1019.811570309589, 0, 1, 0.298804858852407, 0, 0.0009805733030626678, 0.006033627681016749, 0.701195141147593, 1, 0.0006695846137293565],
[434.466174501209, 1019.924351708857, 1, 0, 0.2987273133807917, 0.002301675156064923, 0, -0.01416258314494855, 1, 0.2987273133807917, 0.0006695914043735461],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5056257126226, 1019.952794144554, 0, 1, 0.298740493217599, 0, 0.000980437531757253, 0.006032792258000357, 0.701259506782401, 1, 0.0006695655810293771],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6687925167806, 1019.773182023935, 1, 0, 0.2988560562232401, 0.00230060224524031, 0, -0.01415598134941687, 1, 0.2988560562232401, 0.0006697068702853125],
[434.5274940995762, 1019.762247830459, 0, 1, 0.2987901802311421, 0, 0.0009806207301039994, 0.006033919507347848, 0.7012098197688579, 1, 0.0006695746821352883],
[434.7405803338878, 1019.774966110876, 0, 1, 0.2988902947077557, 0, 0.0009806085001416614, 0.006033844254392184, 0.7011097052922444, 1, 0.0006697155028482594],
[434.4826063474192, 1019.762247830459, 1, 1, 0.2987685361919629, 0.002301588108225405, 0.0009806207301039994, -0.008128128018027493, 0.9107373617817116, 0.5082744341656377, 0.001340442539175951],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481333, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006698072527107783],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 1, 0, 0.2988809052718039, 0.0023005443745173, 0, -0.01415562526140673, 1, 0.2988809052718039, 0.0006697522452128682],
[434.792508109525, 1019.56512746762, 1, 0, 0.2989584524971278, 0.002299947633292932, 0, -0.0141519534151934, 1, 0.2989584524971278, 0.0006695076310369598],
[434.6096488202847, 1019.747986756861, 1, 0, 0.298832720500563, 0.002300915321862791, 0, -0.01415790776100668, 1, 0.298832720500563, 0.0006698072786493108],
[434.6402754988438, 1019.717360078302, 0, 1, 0.2988537790612704, 0, 0.0009806638968304045, 0.006034185119265411, 0.7011462209387296, 1, 0.000669703991836794],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006696773290156468],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 0, 0.2988809052718039, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002536368900518319],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.00041579851379607],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 1, 0.2987258108211561, 0, 0.0009804849456655715, 0.006033084003521881, 0.7012741891788439, 1, 0.0006701121878529793],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 0, 0.2987258108211561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002724364781919264],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0003971298701826462],
[433.9712493926593, 1020.690851405849, 1, 0, 0.2983313094872269, 0.00230430011527145, 0, -0.01417873494765476, 1, 0.2983313094872269, 0.0006696775956489474],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.0840307919269, 1020.578070006581, 0, 0, 0.2984088404816796, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002771826961450616],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.3818787510921, 1020.127989436734, 0, 1, 0.2986448481730058, 0, 0.0009802691528463521, 0.006031756195061932, 0.7013551518269943, 1, 0.0003923554830989685],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[433.9152100438316, 1020.306638239093, 1, 0, 0.2983830909679826, 0.002304597711380032, 0, -0.01418056610511427, 1, 0.2983830909679825, 0.0006700693620505222],
[434.0279914430992, 1020.193856839825, 0, 0, 0.2984606454342429, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002493035264090298],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.3538590766784, 1019.935882853357, 1, 0, 0.2986707851629575, 0.002302270324305938, 0, -0.01416624531233841, 1, 0.2986707851629575, 0.0004204478256515923],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.3413825124547, 1020.016253064691, 1, 0, 0.2986482635958322, 0.002302336457593527, 0, -0.01416665224125784, 1, 0.2986482635958323, 0.0006700921669892675],
[434.4432297182454, 1019.9144058589, 1, 0, 0.2987182925923455, 0.002301796717257032, 0, -0.01416333113081697, 1, 0.2987182925923455, 0.0006697933266778684],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006698174951398878],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006699478846197709],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.677908866888, 0, 1, 0.2988809052718039, 0, 0.0009807018385945472, 0.006034418581136831, 0.7011190947281961, 1, 0.0006698162471931702],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.4267895310443, 1019.930846046101, 1, 0, 0.2987069885039981, 0.002301883825073223, 0, -0.01416386711943645, 1, 0.2987069885039981, 0.000670186535293594],
[434.6096488202846, 1019.747986756861, 1, 0, 0.298832720500563, 0.002300915321862791, 0, -0.01415790776100668, 1, 0.298832720500563, 0.0006697671002826334],
[434.2624800896274, 1020.095155487518, 1, 0, 0.2985940111747654, 0.002302754775852636, 0, -0.0141692262218259, 1, 0.2985940111747654, 0.0006701877829828543],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5274940995762, 1019.830141477569, 0, 1, 0.2987762318359465, 0, 0.0009805554467640675, 0.00603351780829517, 0.7012237681640534, 1, 0.0006697667307973791],
[434.2624800896274, 1020.095155487518, 1, 0, 0.2985940111747654, 0.002302754775852636, 0, -0.0141692262218259, 1, 0.2985940111747654, 0.0006701331223910685],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.5274940995763, 1019.830141477569, 0, 1, 0.2987762318359466, 0, 0.0009805554467640675, 0.00603351780829517, 0.7012237681640534, 1, 0.0006697646594631391],
[434.8714105323523, 1019.486225044793, 1, 0, 0.2990127049181946, 0.002299530334210381, 0, -0.01414938570578516, 1, 0.2990127049181946, 0.0006700278168700981],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.8319593209387, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989855787076612, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010144212923388, 1, 0.0006693914577876411],
[434.858176007958, 1019.273896770652, 1, 0, 0.2990499860009377, 0.002299600318384493, 0, -0.01414981632983829, 1, 0.2990499860009377, 0.0006700043831156079],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.8253420587415, 1019.419512119136, 0, 1, 0.2990042156996729, 0, 0.000980950421403287, 0.006035948151757562, 0.7009957843003272, 1, 0.0006697657113664371],
[433.8752084017206, 1017.607578174165, 1, 0, 0.2989186040747008, 0.002304810186513608, 0, -0.01418187349931261, 1, 0.2989186040747007, 0.000670094325439801],
[434.1705770261549, 1020.187058550991, 1, 0, 0.2985308196589893, 0.002303242211504717, 0, -0.01417222549300116, 1, 0.2985308196589893, 0.000670913904002867],
[434.3413825124547, 1020.016253064691, 1, 0, 0.2986482635958322, 0.002302336457593527, 0, -0.01416665224125784, 1, 0.2986482635958323, 0.0006701959460287736],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 1, 0, 0.2987258108211561, 0.002301738786426253, 0, -0.01416297467295393, 1, 0.2987258108211561, 0.0006700060236641972],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 1, 0, 0.2987258108211561, 0.002301738786426253, 0, -0.01416297467295393, 1, 0.2987258108211561, 0.0006704381260020072],
[434.4399028381243, 1019.917732739021, 0, 1, 0.2987160050668842, 0, 0.0009804712359637758, 0.006032999645487663, 0.7012839949331158, 1, 0.0006699670332086961],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 1, 0, 0.2987258108211561, 0.002301738786426253, 0, -0.01416297467295393, 1, 0.2987258108211561, 0.0006841641503824496],
[434.7520118708875, 1019.953646722906, 0, 2, 0.2988590917362247, 0, 0.001960873424420774, 0.01206557443038928, 0.4915985732409519, 1, 0.001340897219819355],
[433.1664944727551, 1018.507592037767, 0.375, 1.375, 0.2983910083522838, 0.0008657179278292181, 0.001350014482708946, 0.00297995579750821, 0.687972405609002, 0.4621433954579447, 0.0006763128118962374],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 1, 0.2987258108211561, 0, 0.0009804849456655715, 0.006033084003521881, 0.7012741891788439, 1, 0.0006699796552276119],
[434.038502875293, 1020.319132701852, 0, 1, 0.2984400069540321, 0, 0.000980085512414095, 0.006030626225490092, 0.7015599930459679, 1, 0.0006704404669688798],
[435.1168647411433, 1019.701319624588, 0, 1, 0.2990867652172251, 0, 0.0009806793232043265, 0.006034280040263589, 0.7009132347827749, 1, 0.0006699509343205944],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 1, 0, 0.2987258108211561, 0.002301738786426253, 0, -0.01416297467295393, 1, 0.2987258108211561, 0.0006706410790566108],
[434.4684249853202, 1019.889210591825, 0, 1, 0.298735616575428, 0, 0.0009804986557507714, 0.006033168363915248, 0.701264383424572, 1, 0.0006698691962886233],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 1, 0.2987258108211561, 0, 0.0009804849456655715, 0.006033084003521881, 0.7012741891788439, 1, 0.0006699986069928172],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 1, 0.2987258108211561, 0, 0.0009804849456655715, 0.006033084003521881, 0.7012741891788439, 1, 0.0006700357069021928],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 1, 0.2987258108211561, 0, 0.0009804849456655715, 0.006033084003521881, 0.7012741891788439, 1, 0.0006700357317394197],
[434.3413825124546, 1019.903471665423, 1, 0, 0.2986714247361041, 0.002302336457593527, 0, -0.01416665224125784, 1, 0.2986714247361041, 0.000670034752373532],
[434.3840860217495, 1019.973549555396, 1, 0, 0.2986776260499152, 0.002302110119084635, 0, -0.01416525954344701, 1, 0.2986776260499151, 0.0006700357318945947],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.000669697175554488],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 1, 0.2987258108211561, 0, 0.0009804849456655715, 0.006033084003521881, 0.7012741891788439, 1, 0.0006700357319747973],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 1, 0, 0.2987258108211561, 0.002301738786426253, 0, -0.01416297467295393, 1, 0.2987258108211561, 0.0006698691961345248],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 0, 1, 0.2987258108211561, 0, 0.0009804849456655715, 0.006033084003521881, 0.7012741891788439, 1, 0.0006700357324906964],
[434.4541639117223, 1019.903471665423, 1, 0, 0.2987258108211561, 0.002301738786426253, 0, -0.01416297467295393, 1, 0.2987258108211561, 0.0006697244530361225],
[434.3019313010411, 1020.055704276104, 0, 1, 0.2986211373852988, 0, 0.0009803386185754069, 0.006032183629037952, 0.7013788626147012, 1, 0.0006700633295511939],
[434.4650981051991, 1019.734626604328, 1, 0, 0.2987657683623771, 0.002301680858511367, 0, -0.01416261823303284, 1, 0.2987657683623771, 0.0006697804492586766],
[434.3413825124547, 1019.903471665423, 1, 0, 0.2986714247361041, 0.002302336457593527, 0, -0.01416665224125784, 1, 0.2986714247361041, 0.0006701180886945118],
[434.4432297182454, 1019.998744822471, 1, 0, 0.2987009707660795, 0.002301796717257032, 0, -0.01416333113081697, 1, 0.2987009707660795, 0.000669822243023347],
[434.13923047162, 1020.066172494844, 1, 0, 0.2985405153811217, 0.002303408514622525, 0, -0.01417324878324566, 1, 0.2985405153811217, 0.0006699443389638829],
[434.4147127003087, 1019.942922876837, 0, 1, 0.2986986846106227, 0, 0.0009804470206817202, 0.006032850644902334, 0.7013013153893773, 1, 0.0006699860324641797],
[434.2520118708876, 1020.105623706258, 0, 1, 0.298586813344958, 0, 0.0009802906451655369, 0.006031888440812002, 0.701413186655042, 1, 0.0006698968313916829],
[434.6139675316534, 1019.891229489872, 0.5, 1.5, 0.2988053727285661, 0.00115044622895969, 0.001470745072246839, 0.001970851093966076, 0.701194627271434, 0.5083260946856747, 0.001340624482275994],
[434.6063965224035, 1019.841763917556, 0, 2, 0.2988118850457608, 0, 0.001961088544086806, 0.01206689809682773, 0.4916647725530793, 1, 0.001340332142711436],
[434.5669453109899, 1019.790690266156, 1, 0, 0.29880335804648, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988033580464799, 0.0006697768294745321],
[434.4541639117223, 1019.44677383338, 0, 1, 0.2988196462583828, 0, 0.0009809241891459868, 0.006035786740394141, 0.7011803537416172, 1, 0.0006701442545931834],
[434.3840860217495, 1019.669084334033, 1, 0, 0.2987401663692001, 0.002302110119084635, 0, -0.01416525954344701, 1, 0.2987401663692002, 0.0006702740748597171],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.4541639117223, 1019.53111279695, 0, 1, 0.2988023131122611, 0, 0.0009808430438739931, 0.006035287440282914, 0.701197686887739, 1, 0.0006702075737566398],
[434.4541639117223, 1019.613267517659, 1, 0, 0.2987854307998936, 0.002301738786426253, 0, -0.01416297467295393, 1, 0.2987854307998936, 0.0006700423027491328],
[434.5669453109899, 1019.486225044793, 1, 0, 0.2988659246928765, 0.002301141425481334, 0, -0.01415929901349882, 1, 0.2988659246928765, 0.0006698696885528253],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[434.6797267102575, 1019.525676256207, 0, 1, 0.2989121934381107, 0, 0.0009808482741426319, 0.006035319622980055, 0.7010878065618893, 1, 0.0006697865222398044]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.6149167005000435, 2.155869520005639, 0, 0, 0.2219285977204759, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.8584436045904443, 2.238354685835985, 1, 0, 0.2772035903159313, 1.16489888753623, 0, -7.399090457941381, 1, 0.2772035903159313, 0.1574381194766924],
[1.031907331770881, 2.064890958655547, 0, 1, 0.3332174830246332, 0, 0.4842870737596242, 3.076047118508166, 0.6667825169753668, 1, 0.1574381194766924],
[0.7184565650150772, 2.378341725411353, 1, 0, 0.2319997938632759, 1.39187259006954, 0, -8.840759751805829, 1, 0.2319997938632758, 0.1574381194766924],
[0.7179769711389826, 2.378821319287448, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0, 1.912112878314581, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.310366192729586, 1.64590468816207, 1, 0, 0.4432497039426777, 0.7631454516671627, 0, -4.84727240266701, 1, 0.4432497039426777, 0.1574381194766924],
[0.592342706055924, 2.178443514449759, 0, 0, 0.2137814536798939, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.592342706055924, 1.553637783602321, 0, 0, 0.2760242737110143, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.332893671639027, 1.449615493117576, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.858145591340728, 2.238652699085701, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.6149167005000435, 2.155869520005639, 0, 0, 0.2219285977204759, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9687424619402322, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333333, 0.1574381194766924],
[1.03283891142884, 2.063670619418195, 1, 2, 0.3335494049476774, 0.9682051953451186, 0.9691469080292741, 0.005981478229577378, 0.7404525985881814, 0.7039917058256986, 0.1574381194766924],
[0.9508178007681847, 2.145980489658245, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.7179769711389826, 2.378821319287448, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.858145591340728, 2.238652699085701, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.9503377033379826, 2.146460587088447, 1, 0, 0.3068774954687543, 1.052257525390798, 0, -6.683626105852829, 1, 0.3068774954687543, 0.1574381194766924],
[0.7179769711389826, 2.064532193617619, 0, 0, 0.2580322035351813, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.332893671639027, 1.449615493117576, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.4173493963087663, 2.679448894117664, 0, 0, 0.1347680272231412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.030998826269154, 2.065799464157274, 0, 1, 0.3329241137391568, 0, 0.4840740920648569, 3.074694322276382, 0.6670758862608432, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.7179769711389826, 2.377525699782041, 0, 2, 0.2319419646713982, 0, 0.8412106755284915, 5.34311943209552, 0.5899131456328318, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.02775427785626339, 3.069044012570167, 1, 4, 0.00896224915328328, 36.03048168570263, 1.303337450885953, -220.5764674415955, 0.9992110816576677, 0.04401519311702451, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.6149167005000435, 2.155869520005639, 0, 0, 0.2219285977204759, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.6953287267696876, 2.302142870002492, 0, 2, 0.2319717482956138, 0, 0.8687558127084593, 5.345596400830184, 0.5898673954160959, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9212601330057597, 2.07873986699424, 0, 1, 0.30708671100192, 0, 0.4810606732847016, 2.960044889569699, 0.69291328899808, 1, 0.1625180330811244],
[0.6967172793228512, 2.303002900418118, 0, 1, 0.2322607568626664, 0, 0.4342156928323653, 2.671800074122342, 0.7677392431373335, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.921097577172767, 0, 0, 0.342337074877131, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6958146039864452, 2.304185396013555, 0, 1, 0.231938201328815, 0, 0.4339928556660799, 2.670428920644412, 0.768061798671185, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9715366343050728, 2.028463365694926, 0, 1, 0.3238455447683577, 0, 0.4929840079499846, 3.033411115084693, 0.6761544552316423, 1, 0.1625180330811244],
[0.4043040816694237, 2.595695918330577, 0, 0, 0.1347680272231412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9993493271610324, 1.622860332784652, 0, 1, 0.3811096200376795, 0, 0.6161959718887878, 3.791554452183163, 0.6188903799623204, 1, 0.1625180330811244],
[0.9201673604925634, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3151077479125557, 1.086758825551802, 0, -6.687004543116289, 1, 0.3151077479125557, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.11035073338579, 0, 0, 0.2137814536798939, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.9993043754447616, 2.000695624555237, 0, 1, 0.3331014584815874, 0, 0.4998261543268503, 3.075511959201175, 0.6668985415184125, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.4043040816694237, 2.595695918330577, 0, 0, 0.1347680272231412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.9993725988037875, 2.000627401196211, 0, 1, 0.3331241996012627, 0, 0.4998431988895495, 3.075616837179182, 0.6668758003987373, 1, 0.1625180330811244],
[0.9987724394687739, 2.001227560531224, 0, 1, 0.3329241464895915, 0, 0.4996932981147585, 3.074694473230093, 0.6670758535104084, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.920632767533793, 2.079367232466207, 1, 0, 0.306877589177931, 1.086209436884174, 0, -6.683624064918194, 1, 0.306877589177931, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.088482346432169, 0, 0, 0.2219285977204759, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.696162172175431, 2.303837827824569, 0, 1, 0.2320540573918103, 0, 0.4340583299408117, 2.670831794550098, 0.7679459426081897, 1, 0.1625180330811244],
[0.6959995232761336, 2.304000476723867, 1, 0, 0.2319998410920445, 1.436782593316887, 0, -8.840757952070991, 1, 0.2319998410920445, 0.1625180330811244],
[0.9205224048944355, 2.079477595105564, 1, 1, 0.3068408016314786, 1.08633966395927, 0.480890009276217, -3.72543060732731, 0.9058487224541516, 0.5195303257171087, 0.1625180330811244],
[0.9987724680495585, 2.00122753195044, 0, 1, 0.3329241560165197, 0, 0.4996933052511917, 3.074694517141731, 0.6670758439834803, 1, 0.1625180330811244],
[0, 1.852344937246089, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6961619281713527, 2.303838071828648, 0, 1, 0.2320539760571175, 0, 0.4340582839688296, 2.670831511676984, 0.7679460239428825, 1, 0.1625180330811244],
[0.8788461207270267, 2.120991104757569, 12.25, 0.5, 0.2929646026327503, 13.93873137866976, 0.2357388481632272, -84.31675101350993, 0.9999999639301095, 1.763825227540927e-06, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 1.505074891450278, 0, 0, 0.2760242737110143, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1.000000000000001, 6.1531633200411, 0.4444444444444444, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6959993915618887, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2581600699689593, 1.436782865220478, 0, -8.840759625138196, 1, 0.2581600699689593, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.088482346432169, 0, 0, 0.2219285977204759, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9206327675338483, 2.028810961476789, 1, 0, 0.3121377629545981, 1.086209436884109, 0, -6.683624064917792, 1, 0.3121377629545981, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.269407364433712, 1.594457822067638, 1, 0, 0.4432496929034874, 0.7877691811297345, 0, -4.847272429986292, 1, 0.4432496929034875, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.4043040816694237, 2.595695918330577, 0, 0, 0.1347680272231412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9991215185267729, 2.000099467747252, 0, 1, 0.3331270096799355, 0, 0.4999751342998546, 3.076428657306486, 0.6668729903200645, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.269362310014523, 1.594850395764471, 0, 0, 0.4431801826216983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9979400238231383, 2.00205997617686, 0, 2, 0.3326466746077129, 0, 0.9989710716954674, 6.146832156138694, 0.4453604609121438, 1, 0.1625180330811244],
[0.4110566300804656, 2.588943369919535, 0, 2, 0.1370188766934885, 0, 0.7725159318807969, 4.753416696196285, 0.7447364191833683, 1, 0.1625180330811244],
[1.28359586437096, 1.413786251958355, 0, 2, 0.4758672701951916, 0, 1.414641001940449, 8.704517124166157, 0.2747151184526403, 1, 0.1625180330811244],
[0.9998373610601244, 2.000162638939874, 0, 2, 0.333279120353375, 0, 0.9999186871423815, 6.15266298874815, 0.4445167313567694, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.268179791946748, 1.596312738204573, 0, 1, 0.4427240701792839, 0, 0.6264436636174024, 3.854610173042763, 0.5572759298207162, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9195137973765258, 2.080382387206498, 1, 1, 0.3065152061268198, 1.08753126147004, 0.4806808623979858, -3.734049616322466, 0.9060484284130335, 0.5190788406666726, 0.1625180330811244],
[1.291230696968145, 1.404304081669423, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6854964978300192, 1.999899013297486, 0.5, 1.5, 0.2552683561842266, 0.7293983289233138, 0.7500378719257234, 0.1269984789448373, 0.7447316438157734, 0.4453747786994561, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 1, 0.307032525724256, 0, 0.4810230576575289, 2.95981343447232, 0.692967474275744, 1, 0.1625180330811244],
[0.9711889329261212, 2.028811067073878, 1, 0, 0.3237296443087072, 1.029665769550187, 0, -6.335701645098101, 1, 0.3237296443087072, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9206325982685937, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3152168467935209, 1.086209636591915, 0, -6.683625293752542, 1, 0.3152168467935208, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.000600143962848, 1.920032612182489, 0, 1, 0.3425970423215564, 0, 0.5208244868629114, 3.204718128744092, 0.6574029576784436, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.088482346432169, 0, 0, 0.2219285977204759, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.4043040816694237, 2.595695918330577, 0, 0, 0.1347680272231412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.048254193955328, 0, 0, 0.2188442586793272, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9995698809010686, 2.00043011909893, 1, 2, 0.3331899603003564, 1.000430304180978, 0.9997849866912005, -0.003970743907880437, 0.7409318842229891, 0.7035124985451342, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6958146932082679, 2.304185306791732, 0, 1, 0.2319382310694226, 0, 0.4339928724709929, 2.670429024047787, 0.7680617689305774, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.921097577172767, 0, 0, 0.342337074877131, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.269362310014523, 1.594850395764471, 0, 0, 0.4431801826216983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956508547000137, 2.088527410062731, 1, 0, 0.2219118091073073, 1.678835834968503, 0, -10.33015108009876, 1, 0.2219118091073073, 0.1625180330811244],
[0.6959993915613282, 2.304000608438672, 1, 0, 0.2319997971871094, 1.436782865221635, 0, -8.840759625145317, 1, 0.2319997971871094, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5740783011800163, 2.110750693560858, 0, 1, 0.2138230413573969, 0, 0.4737650936468437, 2.915153996543594, 0.7861769586426031, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999798786515335, 0, 1, 0.333355691886799, 0, 0.5000503084325337, 3.076891216022303, 0.666644308113201, 1, 0.1625180330811244],
[1.001901065822519, 1.998098934177479, 0, 1, 0.3339670219408398, 0, 0.5004757186418558, 3.079508834518275, 0.6660329780591602, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6959994018325942, 2.168389228709315, 1, 0, 0.2429835792571622, 1.436782844018199, 0, -8.840759494677108, 1, 0.2429835792571622, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.921097577172767, 1.078902422827232, 0, 0, 0.6403658590575892, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9996524807083277, 2.000347519291671, 0, 1, 0.3332174935694427, 0, 0.4999131352706669, 3.07604716715421, 0.6667825064305573, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.291230696968145, 1.404304081669423, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9998374307535806, 2.000162569246418, 1, 1, 0.333279143584527, 1.000162595679477, 0.4999593609917221, -3.077832196246599, 0.8889250124515642, 0.5554832996206183, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9206327561267432, 2.079367243873256, 1, 0, 0.3068775853755811, 1.086209450342793, 0, -6.683624147731272, 1, 0.3068775853755812, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.001713153610714894, 2.998286846389286, 0, 1, 0.0005710512035716312, 0, 0.3335237924964581, 2.052226366350204, 0.9994289487964284, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9998374295254152, 2.000162570474583, 0, 1, 0.3332791431751386, 0, 0.4999593606847306, 3.076331599676481, 0.6667208568248614, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 1.483206504496657, 0, 0, 0.2865434720694832, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6959994929665002, 2.3040005070335, 1, 0, 0.2319998309888334, 1.436782655886406, 0, -8.84075833707146, 1, 0.2319998309888334, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999272701514327, 2.000072729848565, 1, 1, 0.3333090900504778, 1.000072735138583, 0.4999818181990385, -3.077141086798123, 0.8889050504897225, 0.5555232305906781, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9993725398441268, 2.000627460155871, 1, 1, 0.3331241799480424, 1.000627854109311, 0.4998431841588782, -3.081409862377887, 0.8890282807339442, 0.5552766406300291, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9981171796981415, 2.001882820301857, 0, 2, 0.3327057265660474, 0, 0.9990594752686009, 6.14737611776226, 0.4452816473577467, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333334, 2.000000000000001, 0, -12.3063266400822, 1, 0.111111111111111, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6974170520749805, 2.30258294792502, 0, 1, 0.2324723506916601, 0, 0.4342948864887379, 2.672287365623913, 0.7675276493083398, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.048254193955328, 0, 0, 0.2188442586793272, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.920632767533793, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3152168864801114, 1.086209436884174, 0, -6.683624064918194, 1, 0.3152168864801115, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6623549405561939, 2.336994266360409, 1, 0, 0.2208328856902626, 1.509764536760726, 0, -9.289827769494932, 1, 0.2208328856902626, 0.1625180330811244],
[0.9199853529337496, 2.08001464706625, 2, 0, 0.30666178431125, 2.173947654299258, 0, -13.37665496612357, 0.9999999999999999, 0.09404144995695973, 0.1625180330811244],
[0.9998374307598795, 2.000162569240119, 2, 1, 0.3332791435866266, 2.000325191346351, 0.4999593609932965, -9.231995993971417, 0.9629810232754956, 0.2591870092004973, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.921156373863892, 1, 0, 0.3423301843568453, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3423301843568453, 0.1625180330811244],
[0.5959015955147927, 2.026958676030445, 0, 1, 0.227195326407427, 0, 0.4933499690079425, 3.035662933243084, 0.772804673592573, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0.5000000000000003, -3.07658166002055, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9996524025771055, 2.000347597422893, 0, 1, 0.333217467525702, 0, 0.4999131157446485, 3.07604704700743, 0.666782532474298, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841332152049054, 2.000695652163262, 1, 0, 0.2548144589474466, 1.46170362405294, 0, -8.994101124293689, 1, 0.2548144589474466, 0.1625180330811244],
[0, 1.852344937246089, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.001898049518938, 1.998101950481061, 1, 0, 0.3339660165063127, 0.9981055462480949, 0, -6.141506436703359, 1, 0.3339660165063127, 0.1625180330811244],
[0.9206327561447986, 2.079367243855201, 1, 0, 0.3068775853815995, 1.08620945032149, 0, -6.683624147600193, 1, 0.3068775853815995, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.291185631409195, 1.404696752430591, 1, 0, 0.4789473157839103, 0.7744819766222182, 0, -4.765514090584758, 1, 0.4789473157839103, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999837404452567, 0, 1, 0.333351400484483, 0, 0.5000406521917909, 3.076831799595955, 0.666648599515517, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.622081725332283, 0, 0, 0.3813763660906773, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9993725708599138, 2.000627429140085, 1, 1, 0.3331241902866381, 1.000627823054565, 0.4998431919079621, -3.081409623611589, 0.8890282738458715, 0.5552766544191481, 0.1625180330811244],
[0.9206327675332573, 2.078878392880969, 1, 1, 0.3069276019650215, 1.086209436884806, 0.4810286178472285, -3.723776417694451, 0.9057954471520013, 0.5196506510820444, 0.1625180330811244],
[0.6959993827469896, 2.169230510104596, 1, 1, 0.2429122300041008, 1.436782883417471, 0.460992962869484, -6.004194747181692, 0.9409936485144347, 0.4268181085226366, 0.1625180330811244],
[0.9942013443857304, 1.999892258187314, 0.5, 1.5, 0.3320541961451506, 0.5029162380673767, 0.7500404053564305, 1.520595361658705, 0.6679458038548494, 0.5538484031126991, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.291230696968145, 1.404304081669423, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.302578908529946, 0, 1, 0.2319907952839104, 0, 0.4342956483686539, 2.672292053595466, 0.7680092047160896, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.921097577172767, 1.078902422827232, 0, 0, 0.6403658590575892, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8296073340441711, 2.170392665955827, 0, 1, 0.2765357780147238, 0, 0.4607461201310346, 2.83504612624153, 0.7234642219852762, 1, 0.1625180330811244],
[0.596632665160407, 1.482269757666826, 0, 1, 0.2869940688938194, 0, 0.6746410326646985, 4.15117645638707, 0.7130059311061806, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[1.268179791947204, 1.596312738204008, 0, 1, 0.44272407017946, 0, 0.626443663617624, 3.854610173044127, 0.55727592982054, 1, 0.1625180330811244],
[0.9206327675511653, 2.079367232448834, 1, 0, 0.3068775891837218, 1.086209436863677, 0, -6.683624064792073, 1, 0.3068775891837219, 0.1625180330811244],
[0.4043040816694237, 2.595695918330577, 0, 0, 0.1347680272231412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.921097577172767, 0, 0, 0.342337074877131, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.4043040816694237, 2.595695918330577, 0, 0, 0.1347680272231412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9697880417790902, 2.030211958220909, 3, 1, 0.3232626805930301, 3.09345946821169, 0.4925594078739976, -16.00376285036256, 0.9890800090196483, 0.1023622250227679, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333334, 2.000000000000001, 0, -12.3063266400822, 1, 0.111111111111111, 0.1625180330811244],
[0.9958168594459408, 2.004020589653573, 0, 2, 0.3319569397818083, 0, 0.9979937383506283, 6.140818464449777, 0.4462815303056865, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.028522147195835, 0, 0, 0.3122767214915945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9993725831354762, 2.000627416864522, 1, 1, 0.3331241943784923, 1.000627810763585, 0.499843194974928, -3.081409529111635, 0.8890282711196804, 0.5552766598766651, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6623098778091231, 2.337690122190876, 0, 0, 0.2207699592697077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.297560845328941, 0, 1, 0.232379738578426, 0, 0.4352441860388817, 2.67812856079559, 0.7676202614215739, 1, 0.1625180330811244],
[0.9949823840812301, 2.002779828344867, 0, 2, 0.3319083748393733, 0, 0.9986120150075785, 6.14462282169696, 0.4463464196097673, 1, 0.1625180330811244],
[0.596528778503818, 2.025552946828465, 0, 1, 0.2275019778142967, 0, 0.4936923527798977, 3.037769676510055, 0.7724980221857033, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.302417430208449, 0, 1, 0.2320032909748406, 0, 0.434326107368578, 2.672479472796565, 0.7679967090251594, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0.5, 0, 0.3333333333333334, 0.5000000000000003, 0, -3.07658166002055, 1, 0.183503419072274, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304185234977901, 0, 1, 0.2318665660396958, 0, 0.4339928859971151, 2.670429107276225, 0.7681334339603042, 1, 0.1625180330811244],
[0.6951229054205553, 2.303574209974243, 0, 1, 0.2318083082989319, 0, 0.4341080029764621, 2.671137440851057, 0.768191691701068, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[1.290825246678764, 1.407836900910013, 1, 0, 0.4783204328975011, 0.7746982037831657, 0, -4.766844571620297, 1, 0.478320432897501, 0.1625180330811244],
[1.921097577172767, 1.078902422827232, 0, 0, 0.6403658590575892, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9212601035114713, 2.078739896488528, 0, 1, 0.3070867011704905, 0, 0.481060666459152, 2.960044847570978, 0.6929132988295095, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.00171315128181066, 2.99828684871819, 0, 1, 0.00057105042727022, 0, 0.3335237922373953, 2.052226364756148, 0.9994289495727298, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.921097577172767, 0, 0, 0.342337074877131, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9205224048944328, 2.079477595105566, 1, 0, 0.3068408016314777, 1.086339663959273, 0, -6.684425373379969, 1, 0.3068408016314776, 0.1625180330811244],
[0.9986769358309452, 2.001323064169053, 0, 2, 0.3328923119436486, 0, 0.999338905250861, 6.149095496079622, 0.4450326674638902, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.6969297317752328, 2.167811158568476, 1, 0, 0.2432784529045542, 1.434864885808187, 0, -8.828957984569895, 1, 0.2432784529045542, 0.1625180330811244],
[1.291230696968145, 1.404304081669423, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.001800747925515, 1.917902121389308, 0, 1, 0.343117362541967, 0, 0.5214030418171761, 3.208278071867302, 0.656882637458033, 1, 0.1625180330811244],
[0.9187730888137714, 2.081226911186228, 1, 0, 0.3062576962712572, 1.088408021714154, 0, -6.697152316450027, 1, 0.3062576962712571, 0.1625180330811244],
[1.291230696968145, 1.404304081669423, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9993727244586191, 2.000627275541379, 1, 1, 0.3331242414862066, 1.000627669262958, 0.4998432302835596, -3.081408441175391, 0.8890282397342395, 0.5552767227066526, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.269362310014523, 1.594850395764471, 0, 0, 0.4431801826216983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9206325404363229, 1.999999999999999, 1, 0, 0.315216833233936, 1.086209704825404, 0, -6.68362571360434, 1, 0.315216833233936, 0.1625180330811244],
[1.269362310014523, 1.594850395764471, 0, 0, 0.4431801826216983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9987432235172208, 2.001256776482777, 0, 1, 0.3329144078390738, 0, 0.4996860031912082, 3.07464958637408, 0.6670855921609262, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.287040989044351, 1.410635184743341, 0, 1, 0.4770924700117998, 0, 0.7089005086612424, 4.361980607452832, 0.5229075299882002, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0.5000000000000003, -3.07658166002055, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.1625180330811244],
[0.6984752012081471, 2.314207511407627, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1618338689307419],
[0.8348365458389774, 2.177846166776794, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1618338689307419],
[0.5762534279341123, 1.511437702221437, 0, 0, 0.2760242737110143, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1618338689307419],
[0.01857631624060066, 1.863013079719559, 0, 2, 0.009872672688570991, 0, 1.073529768401337, 6.633529652935396, 0.9803521242888737, 1, 0.1618338689307419],
[0.00172039975297903, 3.010962312862795, 0, 1, 0.000571052419750265, 0, 0.3321197331922794, 2.052226368847504, 0.9994289475802497, 1, 0.1618338689307419],
[1.004227570871924, 2.008455141743847, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4978951131224902, 3.07658166002055, 0.6666666666666667, 1, 0.1618338689307419],
[0.002079539445443867, 3.023246178970305, 0, 1, 0.0006873770426719026, 0, 0.330770284919567, 2.052465257512594, 0.9993126229573281, 1, 0.1611575561188457],
[0.9284046514421255, 2.096921066973622, 1, 0, 0.3068775853755994, 1.07711653366521, 0, -6.683624147730872, 1, 0.3068775853755994, 0.1611575561188457],
[1.008441906138582, 2.016883812277164, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1611575561188457],
[1.008441906138582, 2.016883812277164, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1611575561188457],
[1.289418545957756, 1.406884575943575, 0.375, 1.375, 0.4782172061754344, 0.2908287624492456, 0.9773367506554753, 4.224195771945777, 0.5130059682541351, 0.6796630257079648, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0, 1.852344937246089, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.4034708140679942, 2.596529185932006, 0, 1, 0.1344902713559981, 0, 0.3851295049630097, 2.369764743403977, 0.8655097286440019, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.695999798883209, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2581601820487969, 1.436782024369239, 0, -8.840754451243193, 1, 0.2581601820487969, 0.1625180330811244],
[0.9715954022151571, 2.028404597784842, 0, 1, 0.3238651340717192, 0, 0.4929982909189169, 3.033499000525229, 0.6761348659282809, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6967902839953221, 2.168169005907562, 0, 2, 0.2432112339086472, 0, 0.922437316717767, 5.675907462264894, 0.5727292364820723, 1, 0.1625180330811244],
[0.8316695467872084, 2.16833045321279, 0, 1, 0.2772231822624029, 0, 0.4611843174172606, 2.837742425710078, 0.7227768177375971, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.11035073338579, 0, 0, 0.2137814536798939, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.920632767376258, 2.079367232623742, 1, 0, 0.3068775891254193, 1.086209437070042, 0, -6.683624066061869, 1, 0.3068775891254194, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0, 1.852344937246089, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9206327669675733, 2.079367233032426, 1, 0, 0.3068775889891912, 1.086209437552229, 0, -6.683624069028844, 1, 0.3068775889891912, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6961620419825985, 2.303837958017402, 0, 1, 0.2320540139941994, 0, 0.4340583054116198, 2.670831643617975, 0.7679459860058006, 1, 0.1625180330811244],
[0.6961625410371579, 2.303837458962843, 0, 1, 0.2320541803457193, 0, 0.4340583994368192, 2.670832222170382, 0.7679458196542808, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.000235461530659, 0, 2, 0.3153004347568595, 0, 0.999882283093572, 6.152438988690314, 0.4688134946441456, 1, 0.1625180330811244],
[1.921097577172767, 1.078902422827232, 0, 0, 0.6403658590575892, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.110191852717456, 0, 1, 0.2137941084842666, 0, 0.4738905605725959, 2.91592601502901, 0.7862058915157335, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333334, 2.000000000000001, 0, -12.3063266400822, 1, 0.111111111111111, 0.1625180330811244],
[1.916567630193288, 1.082488567507981, 1, 0, 0.6390569245292262, 0.5217660907166365, 0, -3.210511971038843, 1, 0.6390569245292262, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.028522147195835, 0, 0, 0.3122767214915945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.269362310014523, 1.594850395764471, 0, 0, 0.4431801826216983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.292528093111287, 1.403633821221665, 1, 0, 0.4793955757034225, 0.7736775744601935, 0, -4.760564472706826, 1, 0.4793955757034225, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.597256276818521, 2.091857892898864, 0, 1, 0.2221014948135468, 0, 0.4780439452386584, 2.941482469210247, 0.7778985051864532, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.01734320078306778, 2.982656799216933, 0, 2, 0.005781066927689258, 0, 0.6705431213289709, 4.12596133866729, 0.988471286879444, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.919799334317209, 1.079573120703332, 1, 0, 0.6400670017168847, 0.5208877730732506, 0, -3.205107539132216, 1, 0.6400670017168847, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.11035073338579, 0, 0, 0.2137814536798939, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.269362310014523, 1.594850395764471, 0, 0, 0.4431801826216983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6959993917393712, 2.304000608260629, 1, 0, 0.231999797246457, 1.436782864854093, 0, -8.84075962288377, 1, 0.231999797246457, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[1.919799599917589, 1.079572983488934, 1, 0, 0.6400670628712575, 0.5208877010094839, 0, -3.20510709571209, 1, 0.6400670628712575, 0.1625180330811244],
[1.332893671639027, 1.449615493117576, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9981170753554202, 2.001882924644578, 0, 1, 0.3327056917851403, 0, 0.4995297115976669, 3.073687898673471, 0.6672943082148597, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5984277815670952, 1.482373169597972, 0, 1, 0.2875949192699223, 0, 0.6745939689877181, 4.150886865896167, 0.7124050807300777, 1, 0.1625180330811244],
[0.6961104505803409, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2581906280695966, 1.436553637668145, 0, -8.839349150571234, 1, 0.2581906280695966, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.291230696968145, 1.404304081669423, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9996521761075795, 2.000347823892419, 0, 2, 0.33321739203586, 0, 0.9998261182938964, 6.152093397505073, 0.4445990462834599, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.11035073338579, 0, 0, 0.2137814536798939, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.11035073338579, 0, 0, 0.2137814536798939, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.622081725332283, 0, 0, 0.3813763660906773, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 3, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 1.500000000000001, 3.076581660020549, 0.5925925925925926, 0.8024691358024691, 0.1625180330811244],
[0.001713152320273193, 2.998286847679728, 0, 1, 0.0005710507734243975, 0, 0.3335237923529118, 2.05222636546694, 0.9994289492265755, 1, 0.1625180330811244],
[0.6978580909074402, 2.30214190909256, 1, 0, 0.2326193636358134, 1.432956088106219, 0, -8.817212840564766, 1, 0.2326193636358134, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.695999392313287, 2.294578676024039, 1, 1, 0.2327307217564938, 1.436782863669333, 0.435809854963336, -6.159150401520916, 0.9458364111507015, 0.4112978546636891, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.11035073338579, 0, 0, 0.2137814536798939, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.000600129258809, 1.920195227459466, 0, 2, 0.3425779649222176, 0, 1.041560759759892, 6.408893462548702, 0.432203732205813, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.999372343560616, 2.000627656439383, 0, 1, 0.3331241145202055, 0, 0.4998431351187808, 3.075616444787227, 0.6668758854797945, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9206327561449108, 1.999999999999999, 1, 0, 0.315216883809829, 1.086209450321358, 0, -6.683624147599378, 1, 0.315216883809829, 0.1625180330811244],
[0.5956508547171142, 1.483251568110119, 1, 0, 0.2865217954323466, 1.678835834920305, 0, -10.33015107980219, 1, 0.2865217954323467, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 1.483206504496657, 0, 0, 0.2865434720694832, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9997115584372142, 2.000288441562784, 0, 1.5, 0.3332371861457383, 0, 0.7498918500114319, 4.614207025488102, 0.5444488139723286, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9707288131332747, 2.029271186866724, 1, 1, 0.323576271044425, 1.030153825116455, 0.4927877587145167, -3.306501169219178, 0.895298396816985, 0.5424509389058347, 0.1625180330811244],
[0.9997785012130044, 2.000221498786994, 0, 2, 0.333259500404335, 0, 0.999889262870573, 6.152481936398139, 0.4445428938010769, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.921097577172767, 0, 0, 0.342337074877131, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.269362310014523, 1.594850395764471, 0, 0, 0.4431801826216983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 1.505074891450278, 0, 0, 0.2760242737110143, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244]
],
"RESOLVED": [
[0.6149167005000435, 2.155869520005639, 0, 0, 0.2219285977204759, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.8584436045904443, 2.238354685835985, 1, 0, 0.2772035903159313, 1.16489888753623, 0, -7.399090457941381, 1, 0.2772035903159313, 0.1574381194766924],
[1.031907331770881, 2.064890958655547, 0, 1, 0.3332174830246332, 0, 0.4842870737596242, 3.076047118508166, 0.6667825169753668, 1, 0.1574381194766924],
[0.7184565650150772, 2.378341725411353, 1, 0, 0.2319997938632759, 1.39187259006954, 0, -8.840759751805829, 1, 0.2319997938632758, 0.1574381194766924],
[0.7179769711389826, 2.378821319287448, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0, 1.912112878314581, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.310366192729586, 1.64590468816207, 1, 0, 0.4432497039426777, 0.7631454516671627, 0, -4.84727240266701, 1, 0.4432497039426777, 0.1574381194766924],
[0.592342706055924, 2.178443514449759, 0, 0, 0.2137814536798939, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.592342706055924, 1.553637783602321, 0, 0, 0.2760242737110143, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.332893671639027, 1.449615493117576, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.858145591340728, 2.238652699085701, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.6149167005000435, 2.155869520005639, 0, 0, 0.2219285977204759, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9687424619402322, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333333, 0.1574381194766924],
[1.03283891142884, 2.063670619418195, 1, 2, 0.3335494049476774, 0.9682051953451186, 0.9691469080292741, 0.005981478229577378, 0.7404525985881814, 0.7039917058256986, 0.1574381194766924],
[0.9508178007681847, 2.145980489658245, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.7179769711389826, 2.378821319287448, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.858145591340728, 2.238652699085701, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.9503377033379826, 2.146460587088447, 1, 0, 0.3068774954687543, 1.052257525390798, 0, -6.683626105852829, 1, 0.3068774954687543, 0.1574381194766924],
[0.7179769711389826, 2.064532193617619, 0, 0, 0.2580322035351813, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.332893671639027, 1.449615493117576, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.4173493963087663, 2.679448894117664, 0, 0, 0.1347680272231412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.030998826269154, 2.065799464157274, 0, 1, 0.3329241137391568, 0, 0.4840740920648569, 3.074694322276382, 0.6670758862608432, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.7179769711389826, 2.377525699782041, 0, 2, 0.2319419646713982, 0, 0.8412106755284915, 5.34311943209552, 0.5899131456328318, 1, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.02775427785626339, 3.069044012570167, 1, 4, 0.00896224915328328, 36.03048168570263, 1.303337450885953, -220.5764674415955, 0.9992110816576677, 0.04401519311702451, 0.1574381194766924],
[1.032266096808809, 2.064532193617619, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.6149167005000435, 2.155869520005639, 0, 0, 0.2219285977204759, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.6953287267696876, 2.302142870002492, 0, 2, 0.2319717482956138, 0, 0.8687558127084593, 5.345596400830184, 0.5898673954160959, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9212601330057597, 2.07873986699424, 0, 1, 0.30708671100192, 0, 0.4810606732847016, 2.960044889569699, 0.69291328899808, 1, 0.1625180330811244],
[0.6967172793228512, 2.303002900418118, 0, 1, 0.2322607568626664, 0, 0.4342156928323653, 2.671800074122342, 0.7677392431373335, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.921097577172767, 0, 0, 0.342337074877131, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6958146039864452, 2.304185396013555, 0, 1, 0.231938201328815, 0, 0.4339928556660799, 2.670428920644412, 0.768061798671185, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9715366343050728, 2.028463365694926, 0, 1, 0.3238455447683577, 0, 0.4929840079499846, 3.033411115084693, 0.6761544552316423, 1, 0.1625180330811244],
[0.4043040816694237, 2.595695918330577, 0, 0, 0.1347680272231412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9993493271610324, 1.622860332784652, 0, 1, 0.3811096200376795, 0, 0.6161959718887878, 3.791554452183163, 0.6188903799623204, 1, 0.1625180330811244],
[0.9201673604925634, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3151077479125557, 1.086758825551802, 0, -6.687004543116289, 1, 0.3151077479125557, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.11035073338579, 0, 0, 0.2137814536798939, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.9993043754447616, 2.000695624555237, 0, 1, 0.3331014584815874, 0, 0.4998261543268503, 3.075511959201175, 0.6668985415184125, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.4043040816694237, 2.595695918330577, 0, 0, 0.1347680272231412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.9993725988037875, 2.000627401196211, 0, 1, 0.3331241996012627, 0, 0.4998431988895495, 3.075616837179182, 0.6668758003987373, 1, 0.1625180330811244],
[0.9987724394687739, 2.001227560531224, 0, 1, 0.3329241464895915, 0, 0.4996932981147585, 3.074694473230093, 0.6670758535104084, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.920632767533793, 2.079367232466207, 1, 0, 0.306877589177931, 1.086209436884174, 0, -6.683624064918194, 1, 0.306877589177931, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.088482346432169, 0, 0, 0.2219285977204759, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.696162172175431, 2.303837827824569, 0, 1, 0.2320540573918103, 0, 0.4340583299408117, 2.670831794550098, 0.7679459426081897, 1, 0.1625180330811244],
[0.6959995232761336, 2.304000476723867, 1, 0, 0.2319998410920445, 1.436782593316887, 0, -8.840757952070991, 1, 0.2319998410920445, 0.1625180330811244],
[0.9205224048944355, 2.079477595105564, 1, 1, 0.3068408016314786, 1.08633966395927, 0.480890009276217, -3.72543060732731, 0.9058487224541516, 0.5195303257171087, 0.1625180330811244],
[0.9987724680495585, 2.00122753195044, 0, 1, 0.3329241560165197, 0, 0.4996933052511917, 3.074694517141731, 0.6670758439834803, 1, 0.1625180330811244],
[0, 1.852344937246089, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6961619281713527, 2.303838071828648, 0, 1, 0.2320539760571175, 0, 0.4340582839688296, 2.670831511676984, 0.7679460239428825, 1, 0.1625180330811244],
[0.8792178631714157, 2.120782136828584, 12, 0, 0.2930726210571386, 13.64849430687742, 0, -83.98141454286788, 1, 4.015161150228153e-07, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 1.505074891450278, 0, 0, 0.2760242737110143, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1.000000000000001, 6.1531633200411, 0.4444444444444444, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6959993915618887, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2581600699689593, 1.436782865220478, 0, -8.840759625138196, 1, 0.2581600699689593, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.088482346432169, 0, 0, 0.2219285977204759, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9206327675338483, 2.028810961476789, 1, 0, 0.3121377629545981, 1.086209436884109, 0, -6.683624064917792, 1, 0.3121377629545981, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.269407364433712, 1.594457822067638, 1, 0, 0.4432496929034874, 0.7877691811297345, 0, -4.847272429986292, 1, 0.4432496929034875, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.4043040816694237, 2.595695918330577, 0, 0, 0.1347680272231412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9991215185267729, 2.000099467747252, 0, 1, 0.3331270096799355, 0, 0.4999751342998546, 3.076428657306486, 0.6668729903200645, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.269362310014523, 1.594850395764471, 0, 0, 0.4431801826216983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9979400238231383, 2.00205997617686, 0, 2, 0.3326466746077129, 0, 0.9989710716954674, 6.146832156138694, 0.4453604609121438, 1, 0.1625180330811244],
[0.4110566300804656, 2.588943369919535, 0, 2, 0.1370188766934885, 0, 0.7725159318807969, 4.753416696196285, 0.7447364191833683, 1, 0.1625180330811244],
[1.28359586437096, 1.413786251958355, 0, 2, 0.4758672701951916, 0, 1.414641001940449, 8.704517124166157, 0.2747151184526403, 1, 0.1625180330811244],
[0.9998373610601244, 2.000162638939874, 0, 2, 0.333279120353375, 0, 0.9999186871423815, 6.15266298874815, 0.4445167313567694, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.268179791946748, 1.596312738204573, 0, 1, 0.4427240701792839, 0, 0.6264436636174024, 3.854610173042763, 0.5572759298207162, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9195137973765258, 2.080382387206498, 1, 1, 0.3065152061268198, 1.08753126147004, 0.4806808623979858, -3.734049616322466, 0.9060484284130335, 0.5190788406666726, 0.1625180330811244],
[1.291230696968145, 1.404304081669423, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6854964978300192, 1.999899013297486, 0.5, 1.5, 0.2552683561842266, 0.7293983289233138, 0.7500378719257234, 0.1269984789448373, 0.7447316438157734, 0.4453747786994561, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 1, 0.307032525724256, 0, 0.4810230576575289, 2.95981343447232, 0.692967474275744, 1, 0.1625180330811244],
[0.9711889329261212, 2.028811067073878, 1, 0, 0.3237296443087072, 1.029665769550187, 0, -6.335701645098101, 1, 0.3237296443087072, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9206325982685937, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3152168467935209, 1.086209636591915, 0, -6.683625293752542, 1, 0.3152168467935208, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.000600143962848, 1.920032612182489, 0, 1, 0.3425970423215564, 0, 0.5208244868629114, 3.204718128744092, 0.6574029576784436, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.088482346432169, 0, 0, 0.2219285977204759, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.4043040816694237, 2.595695918330577, 0, 0, 0.1347680272231412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.048254193955328, 0, 0, 0.2188442586793272, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9995698809010686, 2.00043011909893, 1, 2, 0.3331899603003564, 1.000430304180978, 0.9997849866912005, -0.003970743907880437, 0.7409318842229891, 0.7035124985451342, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6958146932082679, 2.304185306791732, 0, 1, 0.2319382310694226, 0, 0.4339928724709929, 2.670429024047787, 0.7680617689305774, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.921097577172767, 0, 0, 0.342337074877131, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.269362310014523, 1.594850395764471, 0, 0, 0.4431801826216983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956508547000137, 2.088527410062731, 1, 0, 0.2219118091073073, 1.678835834968503, 0, -10.33015108009876, 1, 0.2219118091073073, 0.1625180330811244],
[0.6959993915613282, 2.304000608438672, 1, 0, 0.2319997971871094, 1.436782865221635, 0, -8.840759625145317, 1, 0.2319997971871094, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5740783011800163, 2.110750693560858, 0, 1, 0.2138230413573969, 0, 0.4737650936468437, 2.915153996543594, 0.7861769586426031, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999798786515335, 0, 1, 0.333355691886799, 0, 0.5000503084325337, 3.076891216022303, 0.666644308113201, 1, 0.1625180330811244],
[1.001901065822519, 1.998098934177479, 0, 1, 0.3339670219408398, 0, 0.5004757186418558, 3.079508834518275, 0.6660329780591602, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6959994018325942, 2.168389228709315, 1, 0, 0.2429835792571622, 1.436782844018199, 0, -8.840759494677108, 1, 0.2429835792571622, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.921097577172767, 1.078902422827232, 0, 0, 0.6403658590575892, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9996524807083277, 2.000347519291671, 0, 1, 0.3332174935694427, 0, 0.4999131352706669, 3.07604716715421, 0.6667825064305573, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.291230696968145, 1.404304081669423, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9998374307535806, 2.000162569246418, 1, 1, 0.333279143584527, 1.000162595679477, 0.4999593609917221, -3.077832196246599, 0.8889250124515642, 0.5554832996206183, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9206327561267432, 2.079367243873256, 1, 0, 0.3068775853755811, 1.086209450342793, 0, -6.683624147731272, 1, 0.3068775853755812, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.001713153610714894, 2.998286846389286, 0, 1, 0.0005710512035716312, 0, 0.3335237924964581, 2.052226366350204, 0.9994289487964284, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9998374295254152, 2.000162570474583, 0, 1, 0.3332791431751386, 0, 0.4999593606847306, 3.076331599676481, 0.6667208568248614, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 1.483206504496657, 0, 0, 0.2865434720694832, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6959994929665002, 2.3040005070335, 1, 0, 0.2319998309888334, 1.436782655886406, 0, -8.84075833707146, 1, 0.2319998309888334, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999272701514327, 2.000072729848565, 1, 1, 0.3333090900504778, 1.000072735138583, 0.4999818181990385, -3.077141086798123, 0.8889050504897225, 0.5555232305906781, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9993725398441268, 2.000627460155871, 1, 1, 0.3331241799480424, 1.000627854109311, 0.4998431841588782, -3.081409862377887, 0.8890282807339442, 0.5552766406300291, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9981171796981415, 2.001882820301857, 0, 2, 0.3327057265660474, 0, 0.9990594752686009, 6.14737611776226, 0.4452816473577467, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333334, 2.000000000000001, 0, -12.3063266400822, 1, 0.111111111111111, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6974170520749805, 2.30258294792502, 0, 1, 0.2324723506916601, 0, 0.4342948864887379, 2.672287365623913, 0.7675276493083398, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.048254193955328, 0, 0, 0.2188442586793272, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.920632767533793, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3152168864801114, 1.086209436884174, 0, -6.683624064918194, 1, 0.3152168864801115, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6623549405561939, 2.336994266360409, 1, 0, 0.2208328856902626, 1.509764536760726, 0, -9.289827769494932, 1, 0.2208328856902626, 0.1625180330811244],
[0.9199853529337496, 2.08001464706625, 2, 0, 0.30666178431125, 2.173947654299258, 0, -13.37665496612357, 0.9999999999999999, 0.09404144995695973, 0.1625180330811244],
[0.9998374307598795, 2.000162569240119, 2, 1, 0.3332791435866266, 2.000325191346351, 0.4999593609932965, -9.231995993971417, 0.9629810232754956, 0.2591870092004973, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.921156373863892, 1, 0, 0.3423301843568453, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3423301843568453, 0.1625180330811244],
[0.5959015955147927, 2.026958676030445, 0, 1, 0.227195326407427, 0, 0.4933499690079425, 3.035662933243084, 0.772804673592573, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0.5000000000000003, -3.07658166002055, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9996524025771055, 2.000347597422893, 0, 1, 0.333217467525702, 0, 0.4999131157446485, 3.07604704700743, 0.666782532474298, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841332152049054, 2.000695652163262, 1, 0, 0.2548144589474466, 1.46170362405294, 0, -8.994101124293689, 1, 0.2548144589474466, 0.1625180330811244],
[0, 1.852344937246089, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.001898049518938, 1.998101950481061, 1, 0, 0.3339660165063127, 0.9981055462480949, 0, -6.141506436703359, 1, 0.3339660165063127, 0.1625180330811244],
[0.9206327561447986, 2.079367243855201, 1, 0, 0.3068775853815995, 1.08620945032149, 0, -6.683624147600193, 1, 0.3068775853815995, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.291185631409195, 1.404696752430591, 1, 0, 0.4789473157839103, 0.7744819766222182, 0, -4.765514090584758, 1, 0.4789473157839103, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999837404452567, 0, 1, 0.333351400484483, 0, 0.5000406521917909, 3.076831799595955, 0.666648599515517, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.622081725332283, 0, 0, 0.3813763660906773, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9993725708599138, 2.000627429140085, 1, 1, 0.3331241902866381, 1.000627823054565, 0.4998431919079621, -3.081409623611589, 0.8890282738458715, 0.5552766544191481, 0.1625180330811244],
[0.9206327675332573, 2.078878392880969, 1, 1, 0.3069276019650215, 1.086209436884806, 0.4810286178472285, -3.723776417694451, 0.9057954471520013, 0.5196506510820444, 0.1625180330811244],
[0.6959993827469896, 2.169230510104596, 1, 1, 0.2429122300041008, 1.436782883417471, 0.460992962869484, -6.004194747181692, 0.9409936485144347, 0.4268181085226366, 0.1625180330811244],
[0.9942013443857304, 1.999892258187314, 0.5, 1.5, 0.3320541961451506, 0.5029162380673767, 0.7500404053564305, 1.520595361658705, 0.6679458038548494, 0.5538484031126991, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.291230696968145, 1.404304081669423, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.302578908529946, 0, 1, 0.2319907952839104, 0, 0.4342956483686539, 2.672292053595466, 0.7680092047160896, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.921097577172767, 1.078902422827232, 0, 0, 0.6403658590575892, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8296073340441711, 2.170392665955827, 0, 1, 0.2765357780147238, 0, 0.4607461201310346, 2.83504612624153, 0.7234642219852762, 1, 0.1625180330811244],
[0.596632665160407, 1.482269757666826, 0, 1, 0.2869940688938194, 0, 0.6746410326646985, 4.15117645638707, 0.7130059311061806, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[1.268179791947204, 1.596312738204008, 0, 1, 0.44272407017946, 0, 0.626443663617624, 3.854610173044127, 0.55727592982054, 1, 0.1625180330811244],
[0.9206327675511653, 2.079367232448834, 1, 0, 0.3068775891837218, 1.086209436863677, 0, -6.683624064792073, 1, 0.3068775891837219, 0.1625180330811244],
[0.4043040816694237, 2.595695918330577, 0, 0, 0.1347680272231412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.921097577172767, 0, 0, 0.342337074877131, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.4043040816694237, 2.595695918330577, 0, 0, 0.1347680272231412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9697880417790902, 2.030211958220909, 3, 1, 0.3232626805930301, 3.09345946821169, 0.4925594078739976, -16.00376285036256, 0.9890800090196483, 0.1023622250227679, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333334, 2.000000000000001, 0, -12.3063266400822, 1, 0.111111111111111, 0.1625180330811244],
[0.9958168594459408, 2.004020589653573, 0, 2, 0.3319569397818083, 0, 0.9979937383506283, 6.140818464449777, 0.4462815303056865, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.028522147195835, 0, 0, 0.3122767214915945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9993725831354762, 2.000627416864522, 1, 1, 0.3331241943784923, 1.000627810763585, 0.499843194974928, -3.081409529111635, 0.8890282711196804, 0.5552766598766651, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6623098778091231, 2.337690122190876, 0, 0, 0.2207699592697077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.297560845328941, 0, 1, 0.232379738578426, 0, 0.4352441860388817, 2.67812856079559, 0.7676202614215739, 1, 0.1625180330811244],
[0.9949823840812301, 2.002779828344867, 0, 2, 0.3319083748393733, 0, 0.9986120150075785, 6.14462282169696, 0.4463464196097673, 1, 0.1625180330811244],
[0.596528778503818, 2.025552946828465, 0, 1, 0.2275019778142967, 0, 0.4936923527798977, 3.037769676510055, 0.7724980221857033, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.302417430208449, 0, 1, 0.2320032909748406, 0, 0.434326107368578, 2.672479472796565, 0.7679967090251594, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304185234977901, 0, 1, 0.2318665660396958, 0, 0.4339928859971151, 2.670429107276225, 0.7681334339603042, 1, 0.1625180330811244],
[0.6951229054205553, 2.303574209974243, 0, 1, 0.2318083082989319, 0, 0.4341080029764621, 2.671137440851057, 0.768191691701068, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[1.290825246678764, 1.407836900910013, 1, 0, 0.4783204328975011, 0.7746982037831657, 0, -4.766844571620297, 1, 0.478320432897501, 0.1625180330811244],
[1.921097577172767, 1.078902422827232, 0, 0, 0.6403658590575892, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9212601035114713, 2.078739896488528, 0, 1, 0.3070867011704905, 0, 0.481060666459152, 2.960044847570978, 0.6929132988295095, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.00171315128181066, 2.99828684871819, 0, 1, 0.00057105042727022, 0, 0.3335237922373953, 2.052226364756148, 0.9994289495727298, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.921097577172767, 0, 0, 0.342337074877131, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9205224048944328, 2.079477595105566, 1, 0, 0.3068408016314777, 1.086339663959273, 0, -6.684425373379969, 1, 0.3068408016314776, 0.1625180330811244],
[0.9986769358309452, 2.001323064169053, 0, 2, 0.3328923119436486, 0, 0.999338905250861, 6.149095496079622, 0.4450326674638902, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.6969297317752328, 2.167811158568476, 1, 0, 0.2432784529045542, 1.434864885808187, 0, -8.828957984569895, 1, 0.2432784529045542, 0.1625180330811244],
[1.291230696968145, 1.404304081669423, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.001800747925515, 1.917902121389308, 0, 1, 0.343117362541967, 0, 0.5214030418171761, 3.208278071867302, 0.656882637458033, 1, 0.1625180330811244],
[0.9187730888137714, 2.081226911186228, 1, 0, 0.3062576962712572, 1.088408021714154, 0, -6.697152316450027, 1, 0.3062576962712571, 0.1625180330811244],
[1.291230696968145, 1.404304081669423, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9993727244586191, 2.000627275541379, 1, 1, 0.3331242414862066, 1.000627669262958, 0.4998432302835596, -3.081408441175391, 0.8890282397342395, 0.5552767227066526, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.269362310014523, 1.594850395764471, 0, 0, 0.4431801826216983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9206325404363229, 1.999999999999999, 1, 0, 0.315216833233936, 1.086209704825404, 0, -6.68362571360434, 1, 0.315216833233936, 0.1625180330811244],
[1.269362310014523, 1.594850395764471, 0, 0, 0.4431801826216983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9987432235172208, 2.001256776482777, 0, 1, 0.3329144078390738, 0, 0.4996860031912082, 3.07464958637408, 0.6670855921609262, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.287040989044351, 1.410635184743341, 0, 1, 0.4770924700117998, 0, 0.7089005086612424, 4.361980607452832, 0.5229075299882002, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0.5000000000000003, -3.07658166002055, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.1625180330811244],
[0.6984752012081471, 2.314207511407627, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1618338689307419],
[0.8348365458389774, 2.177846166776794, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1618338689307419],
[0.5762534279341123, 1.511437702221437, 0, 0, 0.2760242737110143, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1618338689307419],
[0.01857631624060066, 1.863013079719559, 0, 2, 0.009872672688570991, 0, 1.073529768401337, 6.633529652935396, 0.9803521242888737, 1, 0.1618338689307419],
[0.00172039975297903, 3.010962312862795, 0, 1, 0.000571052419750265, 0, 0.3321197331922794, 2.052226368847504, 0.9994289475802497, 1, 0.1618338689307419],
[1.004227570871924, 2.008455141743847, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4978951131224902, 3.07658166002055, 0.6666666666666667, 1, 0.1618338689307419],
[0.002079539445443867, 3.023246178970305, 0, 1, 0.0006873770426719026, 0, 0.330770284919567, 2.052465257512594, 0.9993126229573281, 1, 0.1611575561188457],
[0.9284046514421255, 2.096921066973622, 1, 0, 0.3068775853755994, 1.07711653366521, 0, -6.683624147730872, 1, 0.3068775853755994, 0.1611575561188457],
[1.008441906138582, 2.016883812277164, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1611575561188457],
[1.008441906138582, 2.016883812277164, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1611575561188457],
[1.289418545957756, 1.406884575943575, 0.375, 1.375, 0.4782172061754344, 0.2908287624492456, 0.9773367506554753, 4.224195771945777, 0.5130059682541351, 0.6796630257079648, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0, 1.852344937246089, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.4034708140679942, 2.596529185932006, 0, 1, 0.1344902713559981, 0, 0.3851295049630097, 2.369764743403977, 0.8655097286440019, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.695999798883209, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2581601820487969, 1.436782024369239, 0, -8.840754451243193, 1, 0.2581601820487969, 0.1625180330811244],
[0.9715954022151571, 2.028404597784842, 0, 1, 0.3238651340717192, 0, 0.4929982909189169, 3.033499000525229, 0.6761348659282809, 1, 0.1625180330811244],
[0.8313220728585727, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2771073576195244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6967902839953221, 2.168169005907562, 0, 2, 0.2432112339086472, 0, 0.922437316717767, 5.675907462264894, 0.5727292364820723, 1, 0.1625180330811244],
[0.8316695467872084, 2.16833045321279, 0, 1, 0.2772231822624029, 0, 0.4611843174172606, 2.837742425710078, 0.7227768177375971, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.11035073338579, 0, 0, 0.2137814536798939, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.920632767376258, 2.079367232623742, 1, 0, 0.3068775891254193, 1.086209437070042, 0, -6.683624066061869, 1, 0.3068775891254194, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0, 1.852344937246089, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9206327669675733, 2.079367233032426, 1, 0, 0.3068775889891912, 1.086209437552229, 0, -6.683624069028844, 1, 0.3068775889891912, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6961620419825985, 2.303837958017402, 0, 1, 0.2320540139941994, 0, 0.4340583054116198, 2.670831643617975, 0.7679459860058006, 1, 0.1625180330811244],
[0.6961625410371579, 2.303837458962843, 0, 1, 0.2320541803457193, 0, 0.4340583994368192, 2.670832222170382, 0.7679458196542808, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.000235461530659, 0, 2, 0.3153004347568595, 0, 0.999882283093572, 6.152438988690314, 0.4688134946441456, 1, 0.1625180330811244],
[1.921097577172767, 1.078902422827232, 0, 0, 0.6403658590575892, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.110191852717456, 0, 1, 0.2137941084842666, 0, 0.4738905605725959, 2.91592601502901, 0.7862058915157335, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333334, 2.000000000000001, 0, -12.3063266400822, 1, 0.111111111111111, 0.1625180330811244],
[1.916567630193288, 1.082488567507981, 1, 0, 0.6390569245292262, 0.5217660907166365, 0, -3.210511971038843, 1, 0.6390569245292262, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.028522147195835, 0, 0, 0.3122767214915945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.269362310014523, 1.594850395764471, 0, 0, 0.4431801826216983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.292528093111287, 1.403633821221665, 1, 0, 0.4793955757034225, 0.7736775744601935, 0, -4.760564472706826, 1, 0.4793955757034225, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.597256276818521, 2.091857892898864, 0, 1, 0.2221014948135468, 0, 0.4780439452386584, 2.941482469210247, 0.7778985051864532, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.01734320078306778, 2.982656799216933, 0, 2, 0.005781066927689258, 0, 0.6705431213289709, 4.12596133866729, 0.988471286879444, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.919799334317209, 1.079573120703332, 1, 0, 0.6400670017168847, 0.5208877730732506, 0, -3.205107539132216, 1, 0.6400670017168847, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.11035073338579, 0, 0, 0.2137814536798939, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.269362310014523, 1.594850395764471, 0, 0, 0.4431801826216983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6959993917393712, 2.304000608260629, 1, 0, 0.231999797246457, 1.436782864854093, 0, -8.84075962288377, 1, 0.231999797246457, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[1.919799599917589, 1.079572983488934, 1, 0, 0.6400670628712575, 0.5208877010094839, 0, -3.20510709571209, 1, 0.6400670628712575, 0.1625180330811244],
[1.332893671639027, 1.449615493117576, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1574381194766924],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9981170753554202, 2.001882924644578, 0, 1, 0.3327056917851403, 0, 0.4995297115976669, 3.073687898673471, 0.6672943082148597, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5984277815670952, 1.482373169597972, 0, 1, 0.2875949192699223, 0, 0.6745939689877181, 4.150886865896167, 0.7124050807300777, 1, 0.1625180330811244],
[0.6961104505803409, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2581906280695966, 1.436553637668145, 0, -8.839349150571234, 1, 0.2581906280695966, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.291230696968145, 1.404304081669423, 0, 0, 0.4790257974785935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9996521761075795, 2.000347823892419, 0, 2, 0.33321739203586, 0, 0.9998261182938964, 6.152093397505073, 0.4445990462834599, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.11035073338579, 0, 0, 0.2137814536798939, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.11035073338579, 0, 0, 0.2137814536798939, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2580322035351812, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.622081725332283, 0, 0, 0.3813763660906773, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 3, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 1.500000000000001, 3.076581660020549, 0.5925925925925926, 0.8024691358024691, 0.1625180330811244],
[0.001713152320273193, 2.998286847679728, 0, 1, 0.0005710507734243975, 0, 0.3335237923529118, 2.05222636546694, 0.9994289492265755, 1, 0.1625180330811244],
[0.6978580909074402, 2.30214190909256, 1, 0, 0.2326193636358134, 1.432956088106219, 0, -8.817212840564766, 1, 0.2326193636358134, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3153258502457379, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6841782647627446, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2548930053359252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 2.026385807001707, 0, 0, 0.2271843446279641, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.168677927141426, 0, 0, 0.2428362869958013, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.695999392313287, 2.294578676024039, 1, 1, 0.2327307217564938, 1.436782863669333, 0.435809854963336, -6.159150401520916, 0.9458364111507015, 0.4112978546636891, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000003, 3.07658166002055, 0.6666666666666666, 1, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 2.11035073338579, 0, 0, 0.2137814536798939, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9210975771727679, 2.078902422827232, 0, 0, 0.307032525724256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.000600129258809, 1.920195227459466, 0, 2, 0.3425779649222176, 0, 1.041560759759892, 6.408893462548702, 0.432203732205813, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.999372343560616, 2.000627656439383, 0, 1, 0.3331241145202055, 0, 0.4998431351187808, 3.075616444787227, 0.6668758854797945, 1, 0.1625180330811244],
[0.6955347786375685, 2.304465221362432, 0, 0, 0.2318449262125228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9206327561449108, 1.999999999999999, 1, 0, 0.315216883809829, 1.086209450321358, 0, -6.683624147599378, 1, 0.315216883809829, 0.1625180330811244],
[0.5956508547171142, 1.483251568110119, 1, 0, 0.2865217954323466, 1.678835834920305, 0, -10.33015107980219, 1, 0.2865217954323467, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333334, 1.000000000000001, 0, -6.1531633200411, 1, 0.3333333333333334, 0.1625180330811244],
[0.5956959183305762, 1.483206504496657, 0, 0, 0.2865434720694832, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9997409689848334, 2.000259031015165, 0, 2, 0.3332469896616114, 0, 0.999870501264512, 6.1523664931719, 0.4445595767953034, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9707288131332747, 2.029271186866724, 1, 1, 0.323576271044425, 1.030153825116455, 0.4927877587145167, -3.306501169219178, 0.895298396816985, 0.5424509389058347, 0.1625180330811244],
[0.9997785012130044, 2.000221498786994, 0, 2, 0.333259500404335, 0, 0.999889262870573, 6.152481936398139, 0.4445428938010769, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.921097577172767, 0, 0, 0.342337074877131, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.9999999999999994, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[1.269362310014523, 1.594850395764471, 0, 0, 0.4431801826216983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244],
[0.5738275313769547, 1.505074891450278, 0, 0, 0.2760242737110143, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1625180330811244]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node138":{
"Global MG94xREV":0.0006697865222398044,
"Nucleotide GTR":0.0006669562034937169,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node139":{
"Global MG94xREV":0.0006698696885528253,
"Nucleotide GTR":0.0006670390183706211,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node150":{
"Global MG94xREV":0.0006697657113664371,
"Nucleotide GTR":0.0006669354805609144,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "L", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TTA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node153":{
"Global MG94xREV":0.0006693914577876411,
"Nucleotide GTR":0.0006665628084664937,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "G", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GGT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node156":{
"Global MG94xREV":0.0006697646594631391,
"Nucleotide GTR":0.0006669344331026467,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "F", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TTT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node159":{
"Global MG94xREV":0.0006697667307973791,
"Nucleotide GTR":0.0006669364956840443,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "F", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "TTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node162":{
"Global MG94xREV":0.0006697671002826334,
"Nucleotide GTR":0.0006669368636079625,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node165":{
"Global MG94xREV":0.0006698162471931702,
"Nucleotide GTR":0.0006669858028382652,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "V", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GTT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node168":{
"Global MG94xREV":0.0006698174951398878,
"Nucleotide GTR":0.0006669870455115316,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node174":{
"Global MG94xREV":0.0004204478256515923,
"Nucleotide GTR":0.0004186711381202965,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "TTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node175":{
"Global MG94xREV":0.0002493035264090298,
"Nucleotide GTR":0.0002482500438129611,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "TTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node179":{
"Global MG94xREV":0.0003923554830989685,
"Nucleotide GTR":0.000390697505456732,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node180":{
"Global MG94xREV":0.0002771826961450616,
"Nucleotide GTR":0.0002760114044648899,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node185":{
"Global MG94xREV":0.00041579851379607,
"Nucleotide GTR":0.0004140414728746482,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node186":{
"Global MG94xREV":0.0002536368900518319,
"Nucleotide GTR":0.0002525650959491192,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node192":{
"Global MG94xREV":0.0003971298701826462,
"Nucleotide GTR":0.0003954517173998005,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node193":{
"Global MG94xREV":0.0002724364781919264,
"Nucleotide GTR":0.0002712852426179915,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node224":{
"Global MG94xREV":0.000669693201962891,
"Nucleotide GTR":0.0006668632775605539,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "V", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GTT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node248":{
"Global MG94xREV":0.000406522701624415,
"Nucleotide GTR":0.0004048048575279551,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node251":{
"Global MG94xREV":0.0003971574568669472,
"Nucleotide GTR":0.0003954791875109739,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node252":{
"Global MG94xREV":0.0002726030402008082,
"Nucleotide GTR":0.000271451100785335,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node269":{
"Global MG94xREV":0.0006698537843692233,
"Nucleotide GTR":0.0006670231813933709,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "F", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "TTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node285":{
"Global MG94xREV":0.001004395965847998,
"Nucleotide GTR":0.001000151687057306,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "T", "I", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ACA", "ATA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node294":{
"Global MG94xREV":0.0004926926680343863,
"Nucleotide GTR":0.0004906106952742679,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node295":{
"Global MG94xREV":0.0001769339968842337,
"Nucleotide GTR":0.0001761863264077855,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node310":{
"Global MG94xREV":0.0005104637250255802,
"Nucleotide GTR":0.0005083066570611397,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "S", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "TCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node316":{
"Global MG94xREV":0.0005075128783723522,
"Nucleotide GTR":0.0005053682798087162,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "C", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TGC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node321":{
"Global MG94xREV":0.0006697068702853125,
"Nucleotide GTR":0.0006668768881247074,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node322":{
"Global MG94xREV":0.0006695655810293771,
"Nucleotide GTR":0.000666736195915169,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node323":{
"Global MG94xREV":0.0006695914043735461,
"Nucleotide GTR":0.0006667619101375628,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node327":{
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node330":{
"Global MG94xREV":0.0005105139707171432,
"Nucleotide GTR":0.0005083566904293458,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTT", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node333":{
"Global MG94xREV":0.0005105139705188493,
"Nucleotide GTR":0.0005083566902318899,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTT", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node336":{
"Global MG94xREV":0.0005105139707171432,
"Nucleotide GTR":0.0005083566904293458,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "I", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ATC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node339":{
"Global MG94xREV":0.0005105139707171432,
"Nucleotide GTR":0.0005083566904293458,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "V", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GTT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node34":{
"Global MG94xREV":0.0006698304499587595,
"Nucleotide GTR":0.0006669999455871896,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTT", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node342":{
"Global MG94xREV":0.0005089896911188301,
"Nucleotide GTR":0.0005068388519835162,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAC", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node345":{
"Global MG94xREV":0.0005105137115352876,
"Nucleotide GTR":0.0005083564323427156,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "V", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GTT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node348":{
"Global MG94xREV":0.000508045557935474,
"Nucleotide GTR":0.0005058987084263454,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "E", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "GAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node351":{
"Global MG94xREV":0.0005080458668683139,
"Nucleotide GTR":0.0005058990160537265,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "A", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "GCG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node354":{
"Global MG94xREV":0.0005105139707171432,
"Nucleotide GTR":0.0005083566904293458,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAT", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node357":{
"Global MG94xREV":0.0005105139707171432,
"Nucleotide GTR":0.0005083566904293458,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "I", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ATT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node360":{
"Global MG94xREV":0.0005105139707439198,
"Nucleotide GTR":0.0005083566904560092,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACT", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node400":{
"Global MG94xREV":0.0006696262831312606,
"Nucleotide GTR":0.0006667966415080145,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node409":{
"Global MG94xREV":0.0003977058694842091,
"Nucleotide GTR":0.0003960252826995336,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "I", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ATC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node410":{
"Global MG94xREV":0.0002719734792279157,
"Nucleotide GTR":0.0002708242001499741,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "I", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ATC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node45":{
"Global MG94xREV":0.0006695813958147455,
"Nucleotide GTR":0.0006667519438719558,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node454":{
"Global MG94xREV":0.0006696836875402646,
"Nucleotide GTR":0.0006668538033430494,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node460":{
"Global MG94xREV":0.0006718212515509302,
"Nucleotide GTR":0.0006689823346436052,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "G", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "GGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node71":{
"Global MG94xREV":0.0006697768294745321,
"Nucleotide GTR":0.0006669465516871893,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000670035671920415,
"Nucleotide GTR":0.0006672043003418371,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "I", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "ATT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_402130_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_402130_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_405839_Guangdong_20200111_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006700043831156079,
"Nucleotide GTR":0.0006671731437542199,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "L", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TTA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_405839_Guangdong_20200111_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000669793580848032,
"Nucleotide GTR":0.0006669632322743646,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAG", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695844139513497,
"Nucleotide GTR":0.0006667549492548118,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGG", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.005079913604431973,
"Nucleotide GTR":0.005058447399565606,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "E", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "S", "M", "L", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "N", "E", "T", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "-", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTA", "TTC", "TGT", "GAA", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TCG", "ATG", "CTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAT", "GAA", "ACG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "---", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413559_California_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006700241176112537,
"Nucleotide GTR":0.000667192794857753,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "V", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "V", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GTA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GTT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413559_California_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413616_USA_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413616_USA_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006841641503824496,
"Nucleotide GTR":0.0006812730760536416,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413695_China_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006763128118962374,
"Nucleotide GTR":0.0006734549149900286,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "-", "-", "-", "-", "IM", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "---", "---", "---", "---", "AT-", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413752_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006706410790566108,
"Nucleotide GTR":0.0006678071492074359,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCA", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697155028482594,
"Nucleotide GTR":0.0006668854842090098,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "N", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAT", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696534993627756,
"Nucleotide GTR":0.0006668237427318245,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTC", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695665529149594,
"Nucleotide GTR":0.0006667371636938526,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "M", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ATG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414522_England_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695846137293565,
"Nucleotide GTR":0.0006667551481886162,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "A", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "GCT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414522_England_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002010127925755035,
"Nucleotide GTR":0.002001633722659884,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGT", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCC", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGC", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414619_USA_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006699478846197709,
"Nucleotide GTR":0.0006671168840042319,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "V", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GTT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414619_USA_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006694425925487573,
"Nucleotide GTR":0.0006666137271473098,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "V", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "GTG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001340897219819355,
"Nucleotide GTR":0.001335230986755812,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "K", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "C", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAA", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGT", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698206730359561,
"Nucleotide GTR":0.000666990209978755,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "F", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "TTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006699443389638829,
"Nucleotide GTR":0.0006671133533312318,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "TTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006699615556923589,
"Nucleotide GTR":0.0006671304973069302,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "I", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ATC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697371983426318,
"Nucleotide GTR":0.0006669070880246714,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "D", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "GAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006699796552276119,
"Nucleotide GTR":0.0006671485203589265,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "S", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "TCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695073752846877,
"Nucleotide GTR":0.0006666782361306542,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAC", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696233569447986,
"Nucleotide GTR":0.0006667937276867458,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "S", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "TCA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697810664553463,
"Nucleotide GTR":0.0006669507707637827,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "C", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TGC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006704404669688798,
"Nucleotide GTR":0.0006676073848467556,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "M", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATG", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006699670332086961,
"Nucleotide GTR":0.0006671359516769111,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "I", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ATC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698691961345248,
"Nucleotide GTR":0.0006670385280331333,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTG", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001340332142711436,
"Nucleotide GTR":0.001334668297495778,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "L", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "CTT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006694930055416787,
"Nucleotide GTR":0.000666663927109908,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAC", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006700921669892675,
"Nucleotide GTR":0.0006672605566793232,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695251951257926,
"Nucleotide GTR":0.0006666959806704089,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCC", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000670913904002867,
"Nucleotide GTR":0.0006680788212765681,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATA", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006704381260020072,
"Nucleotide GTR":0.000667605053772112,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGT", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006694971126012648,
"Nucleotide GTR":0.0006666680168142809,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTC", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "IF", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "WTT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417242_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006703204100454709,
"Nucleotide GTR":0.0006674878352482169,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "I", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "TI", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATT", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "AYC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417288_England_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006699986069928172,
"Nucleotide GTR":0.0006671673920396066,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "N", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "AAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006693367574998366,
"Nucleotide GTR":0.000666508339325845,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACC", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006701331223910685,
"Nucleotide GTR":0.0006673013390157694,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "F", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TTT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417391_New_South_Wales_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000669521439573311,
"Nucleotide GTR":0.0006666922409877747,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "H", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "CAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417391_New_South_Wales_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695224734437833,
"Nucleotide GTR":0.0006666932704894187,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGC", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417438_Kinshasa_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006701017401343959,
"Nucleotide GTR":0.0006672700893711857,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "L", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "CTG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417438_Kinshasa_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000669779729878208,
"Nucleotide GTR":0.0006669494398346215,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "L", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CTT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "MV", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "RTG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698197627314308,
"Nucleotide GTR":0.0006669893035209066,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "F", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTT", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006694946730121046,
"Nucleotide GTR":0.0006666655875341006,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGC", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "G", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GGT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006700278168700981,
"Nucleotide GTR":0.0006671964784846292,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "G", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GGT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418046_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698691962886233,
"Nucleotide GTR":0.0006670385281865804,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "V", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "GTC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418046_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "PS", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "YCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "CF", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TKT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418117_Wales_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697819713626977,
"Nucleotide GTR":0.0006669516718472638,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "R", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CGT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418117_Wales_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418265_Athens_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006702740748597171,
"Nucleotide GTR":0.0006674416958611851,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATT", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418265_Athens_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006701764488371286,
"Nucleotide GTR":0.0006673444823771477,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "T", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "ACT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "V", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GTT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697797300320409,
"Nucleotide GTR":0.0006669494399878045,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "S", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "TCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418388_Finland_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "TTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418388_Finland_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418417_ARA_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697467110714519,
"Nucleotide GTR":0.0006669165605555278,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTT", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418417_ARA_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418750_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695355957447979,
"Nucleotide GTR":0.0006667063373394898,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATC", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418750_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418769_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGY", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418769_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698197624728308,
"Nucleotide GTR":0.0006669893032634,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "F", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTT", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418870_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006701877829828543,
"Nucleotide GTR":0.0006673557686281428,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "F", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "TTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418870_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418952_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697804492586766,
"Nucleotide GTR":0.0006669501561752027,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGA", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418952_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419225_Hong_Kong_20200213_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006694941252194082,
"Nucleotide GTR":0.0006666650420562128,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "P", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "CCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419225_Hong_Kong_20200213_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419238_Basque_Country_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419238_Basque_Country_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697826653891552,
"Nucleotide GTR":0.0006669523629409718,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "G", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GGT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419244_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006700311055655963,
"Nucleotide GTR":0.0006671997532830782,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "G", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "GGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTG", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419244_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006708238491051234,
"Nucleotide GTR":0.0006679891469240527,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "Q", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "G", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAA", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "GGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001341689149846661,
"Nucleotide GTR":0.001336019570322226,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "F", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "L", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "TTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "CTC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006702669897609465,
"Nucleotide GTR":0.0006674346407019355,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "V", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "GTG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419400_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006693315237523387,
"Nucleotide GTR":0.0006665031276946093,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "A", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GCG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419400_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "RM", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AKG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697933266778684,
"Nucleotide GTR":0.0006669629791782485,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAG", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419709_BasqueCountry_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006700357319747973,
"Nucleotide GTR":0.0006672043601424483,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "L", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CTT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419709_BasqueCountry_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419737_Victoria_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "TI", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "F", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "AYT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "TTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419737_Victoria_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696566966096031,
"Nucleotide GTR":0.0006668269264680376,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "I", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "ATT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419832_Northern_Territory_20200221_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006697786287359109,
"Nucleotide GTR":0.000666948343345425,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "V", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GTT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419832_Northern_Territory_20200221_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419856_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006700693620505222,
"Nucleotide GTR":0.0006672378481074697,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "TTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419856_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419881_Victoria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698221003160694,
"Nucleotide GTR":0.0006669916312276081,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "I", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "ATT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419881_Victoria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000669822243023347,
"Nucleotide GTR":0.0006669917733318465,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTG", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420052_Ile_de_France_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698221003160694,
"Nucleotide GTR":0.0006669916312276081,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTT", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420052_Ile_de_France_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCY", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420172_South_Yorkshire_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006694933608248648,
"Nucleotide GTR":0.0006666642808917734,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "T", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ACC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420172_South_Yorkshire_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420210_South_Yorkshire_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698608618660639,
"Nucleotide GTR":0.0006670302289828137,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "I", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ATA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420210_South_Yorkshire_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697522452128682,
"Nucleotide GTR":0.0006669220713113078,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCT", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698099166767883,
"Nucleotide GTR":0.0006669794990727644,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "L", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTG", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697819691486726,
"Nucleotide GTR":0.0006669516696425946,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTG", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420451_Mons_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696566966096031,
"Nucleotide GTR":0.0006668269264680376,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "R", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "AGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420451_Mons_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_28":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006702436508757232,
"Nucleotide GTR":0.0006674114004399044,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "I", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "ATT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420518_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420536_Western_Australia_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGY", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420536_Western_Australia_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATW", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420590_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001591547297117794,
"Nucleotide GTR":0.0001584821891334389,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACT", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420590_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420628_Virginia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006701959460287736,
"Nucleotide GTR":0.0006673638971794574,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTT", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420628_Virginia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420676_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006703166150777208,
"Nucleotide GTR":0.0006674840563168727,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCG", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTY", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420676_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420701_England_20200327_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "F", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "TTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420701_England_20200327_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420720_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "GC", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "KGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420720_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420742_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTM", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420742_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00066979084116633,
"Nucleotide GTR":0.0006669605041697429,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAT", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420756_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420769_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTK", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420769_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420775_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "YTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420775_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "TI", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "AYA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420904_Munich_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696040264432623,
"Nucleotide GTR":0.0006667744788701631,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "D", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAT", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420904_Munich_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420915_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTY", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420915_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "RI", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AKA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTT", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421243_Jiangxi_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001340624482275994,
"Nucleotide GTR":0.001334959401720236,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "G", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421243_Jiangxi_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421286_Wisconsin_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006700357069021928,
"Nucleotide GTR":0.0006672043351757933,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "S", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "TCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421286_Wisconsin_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000670094325439801,
"Nucleotide GTR":0.0006672627060088851,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "RS", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGN", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAC", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00066979084116633,
"Nucleotide GTR":0.0006669605041697429,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACT", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000669703991836794,
"Nucleotide GTR":0.0006668740218396567,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "D", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GAC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421589_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697782336034249,
"Nucleotide GTR":0.0006669479498826518,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "Y", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "TAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421589_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421662_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002013759403714778,
"Nucleotide GTR":0.002005249855073242,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "Y", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TAC", "AGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TAT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421662_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697502063097369,
"Nucleotide GTR":0.0006669200410239754,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGT", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421665_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421666_India_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421666_India_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421807_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698067504222069,
"Nucleotide GTR":0.0006669763461978331,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTT", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421807_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421831_England_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006695221754541128,
"Nucleotide GTR":0.0006666929737589645,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "L", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "CTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421831_England_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421834_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001340442539175951,
"Nucleotide GTR":0.001334778227457651,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "I", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAT", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ATT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421834_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421843_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "YC", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TRC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421843_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698458272186161,
"Nucleotide GTR":0.0006670152578673167,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTT", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421847_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421848_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTR", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421848_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421851_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACY", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421851_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421908_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACY", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421908_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "TM", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "AYG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421917_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695084580498871,
"Nucleotide GTR":0.0006666793143204098,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAC", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422165_Wales_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001591547348577655,
"Nucleotide GTR":0.0001584821942576797,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTT", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422165_Wales_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422190_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "AV", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GYT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422190_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "AV", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GYT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006698206730439503,
"Nucleotide GTR":0.0006669902099867163,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "I", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATT", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422311_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001592144698711958,
"Nucleotide GTR":0.0001585416768486998,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "S", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "TCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422311_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422345_Wales_20200324_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006695366323748978,
"Nucleotide GTR":0.0006667073695890983,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTC", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422345_Wales_20200324_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422354_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698072519345091,
"Nucleotide GTR":0.000666976845590894,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "V", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GTA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422354_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698072786493108,
"Nucleotide GTR":0.0006669768721928062,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "S", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "TCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006700357317394197,
"Nucleotide GTR":0.0006672043599080646,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "V", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GTA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006700357318945947,
"Nucleotide GTR":0.0006672043600625851,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATT", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "YAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422436_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422541_New_York_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006695214389939737,
"Nucleotide GTR":0.0006666922404108864,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTC", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422541_New_York_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422577_Netherlands_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698072519345091,
"Nucleotide GTR":0.000666976845590894,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "I", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ATA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422577_Netherlands_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422633_Zuid_Holland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006700061202370634,
"Nucleotide GTR":0.0006671748735351155,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "E", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GAG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422633_Zuid_Holland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422667_Netherlands_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006695178241976934,
"Nucleotide GTR":0.0006666886408896606,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTC", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422667_Netherlands_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422750_Netherlands_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695221754541128,
"Nucleotide GTR":0.0006666929737589645,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "L", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "CTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422750_Netherlands_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422767_Netherlands_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000159154734855846,
"Nucleotide GTR":0.0001584821942557681,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAT", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422767_Netherlands_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422899_Utrecht_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00066950740207852,
"Nucleotide GTR":0.0006666782628112629,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "CTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422899_Utrecht_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422939_Zuid_Holland_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006697908410865345,
"Nucleotide GTR":0.0006669605040902851,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGT", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422939_Zuid_Holland_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422952_Zuid_Holland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697176549726368,
"Nucleotide GTR":0.0006668876272391502,
"amino-acid": [
["K", "I", "I", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "ATT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422952_Zuid_Holland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696775956489474,
"Nucleotide GTR":0.0006668477371942539,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006701180886945118,
"Nucleotide GTR":0.0006672863688471471,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423075_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696436762541233,
"Nucleotide GTR":0.00066681396113271,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "G", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GGC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423075_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423181_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "AV", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GYT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423181_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423202_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001617964509102786,
"Nucleotide GTR":0.0001611127472034164,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "A", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "GCG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423202_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423203_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "TA", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "RCG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423203_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423210_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006702734105244306,
"Nucleotide GTR":0.0006674410343331821,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "N", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "AAC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423210_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423362_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTY", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423362_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423436_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "SF", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TYT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423436_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423444_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697908161326893,
"Nucleotide GTR":0.0006669604792418862,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAT", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423444_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423449_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "AV", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GYA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423449_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423505_England_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006698197624728308,
"Nucleotide GTR":0.0006669893032634,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "I", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATT", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423505_England_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423509_England_20200331_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006696989324476476,
"Nucleotide GTR":0.0006668689838299859,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "H", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CAC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423509_England_20200331_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423558_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "GC", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "KGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423558_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423559_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "TI", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "AYA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423559_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423610_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "TI", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "AYC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423610_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423675_England_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "L", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TTA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423675_England_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "AS", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "KCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423687_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423701_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "PL", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CYT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423701_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423702_England_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "LF", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTW", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423702_England_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423716_England_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0001591547299193011,
"Nucleotide GTR":0.0001584821893400838,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTT", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423716_England_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423719_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "AV", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GYT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423719_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423757_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "NS", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "ART", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423757_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423770_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "KN", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAW", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423770_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423784_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "SI", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "AKT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423784_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423791_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001591547296576611,
"Nucleotide GTR":0.0001584821890795495,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "I", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ATC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423791_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423804_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006698201684981099,
"Nucleotide GTR":0.0006669897075729358,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "I", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATT", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423804_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "TI", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "AYT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423814_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423833_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACW", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423833_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423855_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "PA", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "SCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423855_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423863_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697630073760117,
"Nucleotide GTR":0.0006669327879967488,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTA", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423863_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423868_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "TI", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "AYT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423868_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423900_England_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAY", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423900_England_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423906_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "SF", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TYC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423906_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423917_England_20200318_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423917_England_20200318_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423952_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000159154734855846,
"Nucleotide GTR":0.0001584821942557681,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "I", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ATT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423952_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTY", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423967_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423969_England_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006697910681741328,
"Nucleotide GTR":0.0006669607302182779,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTT", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423969_England_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423999_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTY", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423999_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424000_England_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0001602768829654657,
"Nucleotide GTR":0.0001595996005010401,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAC", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424000_England_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424001_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAY", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424001_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424025_England_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "AV", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GYT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424025_England_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424035_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006698206730439503,
"Nucleotide GTR":0.0006669902099867163,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424035_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424060_England_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "HY", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "YAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424060_England_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424070_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "SC", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TSC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424070_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424125_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "GC", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "KGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424125_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424131_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "AV", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GYA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424131_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424156_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "KE", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "RAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424156_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424280_Washington_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006697908419380599,
"Nucleotide GTR":0.0006669605049382115,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTT", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424280_Washington_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006700633295511939,
"Nucleotide GTR":0.0006672318410996899,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "F", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424328_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696989065002095,
"Nucleotide GTR":0.0006668689579921932,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "S", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "AGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424328_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424332_Washington_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006697916570889873,
"Nucleotide GTR":0.000666961316644554,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTT", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424332_Washington_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0006697244530361225,
"Nucleotide GTR":0.0006668943965760401,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTC", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424579_Reykjavik_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000669679246053071,
"Nucleotide GTR":0.00066684938062426,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCA", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424579_Reykjavik_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424613_Reykjavik_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695076310369598,
"Nucleotide GTR":0.0006666784908021944,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAC", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424613_Reykjavik_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424641_Li_ge_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006700645518923649,
"Nucleotide GTR":0.0006672330582756106,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424641_Li_ge_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000670034752373532,
"Nucleotide GTR":0.0006672033846806865,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424943_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696436762541233,
"Nucleotide GTR":0.00066681396113271,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "R", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CGA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424943_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424982_Michigan_20200310_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006700357324906964,
"Nucleotide GTR":0.0006672043606561673,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "V", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GTA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424982_Michigan_20200310_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006699860324641797,
"Nucleotide GTR":0.0006671548706471896,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "H", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CAC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006708463595831751,
"Nucleotide GTR":0.0006680115622795156,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "L", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "CTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425199_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006700061202370634,
"Nucleotide GTR":0.0006671748735351155,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACA", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425199_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425208_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695221753746003,
"Nucleotide GTR":0.0006666929736797867,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGC", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425208_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425259_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006702436508771425,
"Nucleotide GTR":0.0006674114004413163,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTA", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425259_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425263_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698072527107783,
"Nucleotide GTR":0.0006669768463638831,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425263_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425291_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696566695781354,
"Nucleotide GTR":0.0006668268995507969,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTA", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425291_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425387_England_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "I", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ATC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425387_England_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425504_England_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006695629032835069,
"Nucleotide GTR":0.0006667335294846569,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "V", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GTA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425504_England_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425611_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695704209191022,
"Nucleotide GTR":0.000666741015352959,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTG", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425611_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425615_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006695213801768897,
"Nucleotide GTR":0.0006666921818423457,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATC", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425615_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425643_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00066979084116633,
"Nucleotide GTR":0.0006669605041697429,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAT", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425643_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425683_Scotland_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006697919091592352,
"Nucleotide GTR":0.0006669615676496274,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425683_Scotland_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006698072787285381,
"Nucleotide GTR":0.0006669768722716983,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "TTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425755_Scotland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696436762266104,
"Nucleotide GTR":0.0006668139611053128,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "G", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "GGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425755_Scotland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425764_Scotland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTY", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425764_Scotland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425765_Scotland_20200313_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0001591547348262645,
"Nucleotide GTR":0.0001584821942263121,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "V", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GTT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425765_Scotland_20200313_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425767_Scotland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425767_Scotland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425850_Scotland_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697908410865345,
"Nucleotide GTR":0.0006669605040902851,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "L", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TTA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425850_Scotland_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001618263319583979,
"Nucleotide GTR":0.0001611425019831086,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "C", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TGC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425941_Scotland_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006697916570889873,
"Nucleotide GTR":0.000666961316644554,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "I", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ATA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425941_Scotland_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426044_New_York_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695693115406054,
"Nucleotide GTR":0.0006667399106623664,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "V", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "GTA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426044_New_York_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006697810664553463,
"Nucleotide GTR":0.0006669507707637827,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "A", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "GCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426057_Idaho_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00066979084116633,
"Nucleotide GTR":0.0006669605041697429,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "F", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TTT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426057_Idaho_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426101_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "V", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GTT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426101_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426109_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "T", "IL", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ACA", "WTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426109_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426161_Wisconsin_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "F", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "TTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426161_Wisconsin_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_14":{
"Global MG94xREV":0.000669697175554488,
"Nucleotide GTR":0.0006668672343609343,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTC", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426291_New_York_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAY", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426291_New_York_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695693115406054,
"Nucleotide GTR":0.0006667399106623664,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCG", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426421_Hawaii_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "RC", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "YGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426421_Hawaii_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006702075737566398,
"Nucleotide GTR":0.0006673754757720013,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "C", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TGT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426569_Arizona_20200402_null_14":{
"Global MG94xREV":0.0006701988011321488,
"Nucleotide GTR":0.0006673667402180143,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "N", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "AAT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426569_Arizona_20200402_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698075680891531,
"Nucleotide GTR":0.0006669771604095624,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "F", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "TTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426661_Victoria_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00066979084116633,
"Nucleotide GTR":0.0006669605041697429,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "Y", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "TAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426661_Victoria_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426673_Victoria_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000670186535293594,
"Nucleotide GTR":0.0006673545262112462,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426673_Victoria_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426682_Victoria_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006698705553930454,
"Nucleotide GTR":0.0006670398815478321,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCT", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426682_Victoria_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426699_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006701121878529793,
"Nucleotide GTR":0.0006672804929408161,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426699_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426718_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698220995738062,
"Nucleotide GTR":0.000666991630488481,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "I", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATT", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426718_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426770_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000669698906492359,
"Nucleotide GTR":0.0006668689579843763,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "T", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "ACA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426770_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006696773290156468,
"Nucleotide GTR":0.0006668474716876654,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426786_Victoria_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "GV", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GKT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426786_Victoria_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006695073744769428,
"Nucleotide GTR":0.0006666782353263226,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAC", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426815_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "GV", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GKC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426815_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426929_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "F", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TTT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426929_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426935_Victoria_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000669569283733087,
"Nucleotide GTR":0.000666739882972354,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "V", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "GTT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426935_Victoria_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427007_Victoria_20200329_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006698072786493108,
"Nucleotide GTR":0.0006669768721928062,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATT", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427007_Victoria_20200329_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427029_Victoria_20200330_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427029_Victoria_20200330_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427063_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696566695859354,
"Nucleotide GTR":0.0006668268995585636,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "T", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "ACA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427063_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_20":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427148_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006695746821352883,
"Nucleotide GTR":0.0006667452585625118,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427148_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001339583512648785,
"Nucleotide GTR":0.001333922830921239,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "V", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "GTC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCC", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427234_Washington_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001005250709358614,
"Nucleotide GTR":0.001001002818675921,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "T", "K", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ACA", "AAA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427234_Washington_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427265_Washington_20200331_null_13":{
"Global MG94xREV":0.0006700060236641972,
"Nucleotide GTR":0.0006671747773703377,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTA", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427265_Washington_20200331_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427286_Minnesota_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006698072786493108,
"Nucleotide GTR":0.0006669768721928062,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427286_Minnesota_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427369_Liege_20200407_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0001591550378056721,
"Nucleotide GTR":0.0001584824959254186,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "V", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GTT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427369_Liege_20200407_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427373_Liege_20200407_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427373_Liege_20200407_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427386_Liege_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427386_Liege_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "SF", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TYT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006698968313916829,
"Nucleotide GTR":0.0006670660465119087,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "M", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATG", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427492_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006698072525569165,
"Nucleotide GTR":0.0006669768462106707,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "I", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ATT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427492_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427570_New_York_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006696566966096031,
"Nucleotide GTR":0.0006668269264680376,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "S", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "AGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427570_New_York_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427611_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698072519345091,
"Nucleotide GTR":0.000666976845590894,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "L", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TTA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427611_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427621_Alaska_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000669602637292253,
"Nucleotide GTR":0.0006667730955892933,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "L", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "TTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427621_Alaska_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427629_New_York_20200330_null_6":{
"Global MG94xREV":0.000669807252549105,
"Nucleotide GTR":0.0006669768462028923,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAT", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427629_New_York_20200330_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427635_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006698072787285381,
"Nucleotide GTR":0.0006669768722716983,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAT", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427635_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427644_New_South_Wales_20200302_null_29":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427644_New_South_Wales_20200302_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427684_New_South_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006700423027491328,
"Nucleotide GTR":0.0006672109031506448,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCG", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427684_New_South_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_58":{
"Global MG94xREV":0.0002630641185978112,
"Nucleotide GTR":0.0002619524878295471,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_58",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427731_New_South_Wales_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001617970710448672,
"Nucleotide GTR":0.0001611133647175004,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "E", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "GAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427731_New_South_Wales_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00066950740207852,
"Nucleotide GTR":0.0006666782628112629,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "A", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GCA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000669569283733087,
"Nucleotide GTR":0.000666739882972354,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "G", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GGA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427774_New_South_Wales_20200322_null_1012":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427774_New_South_Wales_20200322_null_1012",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427777_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006699509343205944,
"Nucleotide GTR":0.0006671199208179257,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "L", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CTA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427777_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427806_New_South_Wales_20200326_null_164":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427806_New_South_Wales_20200326_null_164",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006701442545931834,
"Nucleotide GTR":0.0006673124241765073,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "Y", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "TAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428206_Nebraska_20200325_null_8229":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428206_Nebraska_20200325_null_8229",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":8762.129078744609,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02253690214941413],
[0.01127606271256748],
[0.008618644562972308],
[0.03588393818977322],
[0.01916986948698596],
[0.009591409196077417],
[0.007331011615152057],
[0.03052284680549613],
[0.01421214153114034],
[0.00711087078971896],
[0.0054350591542476],
[0.02262900219678181],
[0.02690953115851489],
[0.01346385403359843],
[0.01029084134429263],
[0.04284617053426871],
[0.01064313623684002],
[0.005325162742836302],
[0.004070187093703975],
[0.01694632387078235],
[0.009053042482936724],
[0.004529578825889604],
[0.003462097623561288],
[0.01441452843577872],
[0.006711736933956158],
[0.003358135296315003],
[0.002566726990712228],
[0.01068663082829074],
[0.01270812662231888],
[0.006358355367676],
[0.004859888270928999],
[0.02023426410603451],
[0.02286200251319998],
[0.0114387226942111],
[0.008742970633351776],
[0.0364015728354855],
[0.01944639957539958],
[0.009729767635857253],
[0.007436763263147132],
[0.03096314638768626],
[0.01441715517282534],
[0.00721344685209193],
[0.005513461221068014],
[0.0229554311264329],
[0.0272977077726272],
[0.01365807344384672],
[0.01043928926506327],
[0.04346423709617565],
[0.0132202011908466],
[0.0420707914172898],
[0.02247500194706894],
[0.01124509170515318],
[0.008594972461152268],
[0.03578537881279395],
[0.008336876521396544],
[0.00637213337091715],
[0.02653053369915575],
[0.03154908099885163],
[0.01578519592037942],
[0.0120651149663262],
[0.05023340231063528]
],
"Log Likelihood":-4031.205235819719,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5341150032599065, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":349
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":9398.761423170754,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2659787433690028],
[0.1770561063673953],
[0.1873193806467314],
[0.3696457696168705]
],
"Log Likelihood":-4123.60492947896,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.1571461734810783,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.2686670234843277,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.126325115707539,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.067331398217212,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.4738901715496311
},
"display order":0,
"estimated parameters":575
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-20/sequences.nsp4.compressed.fas",
"number of sequences":285,
"number of sites":500,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_414482_USA_20200218_null_1,epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1,epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1,epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1,epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1,epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1,epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_419832_Northern_Territory_20200221_null_2,epi_isl_420172_South_Yorkshire_20200324_null_2,epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1,(epi_isl_420769_England_20200331_null_1,epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1,epi_isl_422345_Wales_20200324_null_5)Node34,epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1,epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1,epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1,epi_isl_420210_South_Yorkshire_20200327_null_1,epi_isl_419400_Wales_20200316_null_1,epi_isl_425615_England_20200329_null_3,epi_isl_421589_New_York_20200318_null_1,epi_isl_423863_England_20200317_null_1,epi_isl_427621_Alaska_20200325_null_1,epi_isl_422667_Netherlands_20200316_null_5,epi_isl_422952_Zuid_Holland_20200327_null_1,epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_423967_England_20200320_null_1,epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1,epi_isl_417438_Kinshasa_20200317_null_1,(epi_isl_418750_England_20200318_null_1,epi_isl_421665_India_20200310_null_1,epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1,epi_isl_421662_India_20200310_null_1,epi_isl_427644_New_South_Wales_20200302_null_29)Node400,((epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1,epi_isl_425387_England_20200313_null_2)Node410,epi_isl_417288_England_20200305_null_1)Node409,epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1,epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1,epi_isl_421831_England_20200323_null_3,epi_isl_426718_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2,epi_isl_427286_Minnesota_20200323_null_2,epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1,epi_isl_423509_England_20200331_null_6,epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1,epi_isl_420904_Munich_20200315_null_1,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_428206_Nebraska_20200325_null_8229,epi_isl_422577_Netherlands_20200330_null_1,epi_isl_418117_Wales_20200314_null_1,epi_isl_423444_England_20200330_null_1,epi_isl_420451_Mons_20200307_null_1,(epi_isl_402130_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_426569_Arizona_20200402_null_14)Node45,epi_isl_421807_England_20200325_null_1,epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_1,epi_isl_426770_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_427063_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_424035_England_20200320_null_2,epi_isl_426661_Victoria_20200321_null_2,epi_isl_419225_Hong_Kong_20200213_null_1,(epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_1,epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_28,(epi_isl_419244_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_1)Node460,epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1)Node454,epi_isl_421847_England_20200326_null_1,epi_isl_426935_Victoria_20200329_null_1,epi_isl_424579_Reykjavik_20200326_null_1,epi_isl_426682_Victoria_20200322_null_2,epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1,epi_isl_425199_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1,epi_isl_425941_Scotland_20200326_null_3,epi_isl_422354_Wales_20200326_null_1,epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_422899_Utrecht_20200303_null_1,epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1,epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1,epi_isl_422939_Zuid_Holland_20200324_null_3,epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_3,epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1,epi_isl_423075_England_20200323_null_1,epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1,epi_isl_425208_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1,epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1,epi_isl_423969_England_20200320_null_3,epi_isl_417391_New_South_Wales_20200308_null_1,epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1,epi_isl_424332_Washington_20200322_null_4,epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_425755_Scotland_20200319_null_1,epi_isl_427492_New_York_20200401_null_2,epi_isl_423804_England_20200324_null_2,epi_isl_425643_England_20200330_null_1,epi_isl_422541_New_York_20200319_null_2,epi_isl_419881_Victoria_20200319_null_1,epi_isl_420756_England_20200327_null_2,epi_isl_422750_Netherlands_20200325_null_1,epi_isl_420052_Ile_de_France_20200320_null_1,epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1,epi_isl_427570_New_York_20200315_null_1,epi_isl_423505_England_20200330_null_3,epi_isl_425683_Scotland_20200312_null_2,epi_isl_425611_England_20200329_null_1,epi_isl_423210_England_20200327_null_1,epi_isl_426057_Idaho_20200321_null_1,epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_4,epi_isl_422633_Zuid_Holland_20200331_null_1,epi_isl_424943_New_York_20200401_null_1,epi_isl_425291_England_20200320_null_1,epi_isl_422304_Wales_20200324_null_2,epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_427635_New_York_20200405_null_1,epi_isl_420518_England_20200323_null_1,epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_1,epi_isl_426044_New_York_20200306_null_1,epi_isl_425259_England_20200101_null_1,epi_isl_425850_Scotland_20200315_null_1,epi_isl_427611_New_York_20200316_null_1,epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_1,epi_isl_424280_Washington_20200323_null_4,epi_isl_427629_New_York_20200330_null_6,epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_1,epi_isl_424328_Washington_20200324_null_1,(epi_isl_420590_New_York_20200318_null_1,epi_isl_421851_England_20200327_null_1)Node360,(epi_isl_423868_England_20200318_null_3,epi_isl_423952_England_20200319_null_1)Node357,(epi_isl_422767_Netherlands_20200327_null_1,epi_isl_426291_New_York_20200308_null_1)Node354,(epi_isl_423202_England_20200324_null_1,epi_isl_423203_England_20200324_null_1)Node351,(epi_isl_424156_England_20200320_null_1,epi_isl_427731_New_South_Wales_20200317_null_2)Node348,(epi_isl_424025_England_20200320_null_3,epi_isl_427369_Liege_20200407_null_5)Node345,(epi_isl_424000_England_20200321_null_3,epi_isl_424001_England_20200319_null_1)Node342,(epi_isl_422190_Wales_20200330_null_1,epi_isl_425765_Scotland_20200313_null_4)Node339,(epi_isl_423610_England_20200323_null_1,epi_isl_423791_England_20200323_null_2)Node336,(epi_isl_423716_England_20200323_null_4,epi_isl_425764_Scotland_20200313_null_1)Node333,(epi_isl_422165_Wales_20200330_null_2,epi_isl_423999_England_20200321_null_2)Node330,(epi_isl_421843_England_20200324_null_1,epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_2)Node316,(epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1,epi_isl_422311_Wales_20200327_null_1)Node310,epi_isl_427416_Doha_20200323_null_1,epi_isl_423181_England_20200320_null_1,epi_isl_421908_England_20200328_null_1,epi_isl_423449_England_20200329_null_1,(epi_isl_413559_California_20200227_null_1,epi_isl_426101_Washington_20200325_null_1)Node224,epi_isl_425504_England_20200318_null_4,epi_isl_423687_England_20200323_null_1,epi_isl_423757_England_20200324_null_1,epi_isl_423906_England_20200319_null_1,epi_isl_424070_England_20200321_null_1,epi_isl_424125_England_20200311_null_1,epi_isl_424131_England_20200321_null_2,epi_isl_417242_England_20200303_null_1,epi_isl_422436_England_20200327_null_1,epi_isl_421848_England_20200327_null_1,(epi_isl_423900_England_20200318_null_6,epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_58)Node248,((epi_isl_424641_Li_ge_20200403_null_3,epi_isl_427373_Liege_20200407_null_7)Node252,epi_isl_423559_England_20200401_null_1)Node251,epi_isl_423558_England_20200331_null_1,epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1,epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1,epi_isl_420915_Wales_20200313_null_1,epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1,epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1,(epi_isl_419737_Victoria_20200307_null_1,epi_isl_420701_England_20200327_null_9)Node269,epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2,epi_isl_418769_England_20200318_null_1,epi_isl_421917_England_20200327_null_1,epi_isl_420676_England_20200328_null_1,epi_isl_423784_England_20200322_null_1,epi_isl_423436_England_20200330_null_1,epi_isl_423719_England_20200323_null_1,(epi_isl_426109_Washington_20200325_null_1,epi_isl_427234_Washington_20200329_null_2)Node285,epi_isl_423701_England_20200323_null_1,epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1,((epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1,epi_isl_427386_Liege_20200408_null_4)Node295,epi_isl_424060_England_20200307_null_1)Node294,epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1,epi_isl_423770_England_20200322_null_1,epi_isl_423814_England_20200323_null_1,epi_isl_423833_England_20200323_null_1,epi_isl_423855_England_20200317_null_1,epi_isl_418417_ARA_20200316_null_1,epi_isl_420742_England_20200328_null_1,epi_isl_420720_England_20200328_null_1,(((epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1,epi_isl_414522_England_20200228_null_1)Node323,epi_isl_427029_Victoria_20200330_null_7)Node322,epi_isl_421666_India_20200310_null_4)Node321,epi_isl_427148_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1,epi_isl_421834_England_20200326_null_1,epi_isl_425263_England_20200401_null_1,epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1,epi_isl_424613_Reykjavik_20200327_null_1,epi_isl_427007_Victoria_20200329_null_6,epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_2,((epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_2,epi_isl_426815_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_8)Node186,epi_isl_426786_Victoria_20200323_null_4)Node185,((epi_isl_426699_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_20)Node193,epi_isl_423362_England_20200328_null_1)Node192,((epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1,epi_isl_423917_England_20200318_null_7)Node180,epi_isl_423702_England_20200323_null_3)Node179,((epi_isl_418388_Finland_20200313_null_2,epi_isl_419856_Victoria_20200318_null_1)Node175,epi_isl_420775_England_20200330_null_1)Node174,epi_isl_420536_Western_Australia_20200315_null_2,(epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1,epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1,epi_isl_425767_Scotland_20200313_null_1)Node168,(epi_isl_414619_USA_20200307_null_1,epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1)Node165,(epi_isl_413616_USA_20200217_null_1,epi_isl_426673_Victoria_20200322_null_2)Node162,(epi_isl_418870_Washington_20200316_null_1,epi_isl_426161_Wisconsin_20200406_null_4)Node159,(epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2,epi_isl_426929_Victoria_20200328_null_1)Node156,(epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1,epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_1)Node153,(epi_isl_405839_Guangdong_20200111_null_1,epi_isl_423675_England_20200320_null_3)Node150,epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1,(epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2,epi_isl_420628_Virginia_20200313_null_1,epi_isl_427265_Washington_20200331_null_13,epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1,epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1,epi_isl_427774_New_South_Wales_20200322_null_1012,epi_isl_413695_China_20200101_null_1,epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1,epi_isl_413752_China_20200201_null_1,epi_isl_426421_Hawaii_20200307_null_1,epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1,epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_427777_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1,epi_isl_418046_Washington_20200316_null_1,epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1,epi_isl_421286_Wisconsin_20200325_null_2,epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_1,epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_1,epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2,epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_14,epi_isl_419709_BasqueCountry_20200304_null_1,epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1,epi_isl_424982_Michigan_20200310_null_2,epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_15,epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1,epi_isl_418952_Washington_20200316_null_1,epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_1,epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_415600_USA_20200309_null_1,epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_1,epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2,epi_isl_421243_Jiangxi_20200121_null_1,epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1)Node71,((epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_1,epi_isl_418265_Athens_20200318_null_1,epi_isl_427806_New_South_Wales_20200326_null_164,epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1,epi_isl_427684_New_South_Wales_20200323_null_1)Node139,epi_isl_419238_Basque_Country_20200305_null_1)Node138)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node138":"test",
"Node139":"test",
"Node150":"test",
"Node153":"test",
"Node156":"test",
"Node159":"test",
"Node162":"test",
"Node165":"test",
"Node168":"test",
"Node174":"test",
"Node175":"test",
"Node179":"test",
"Node180":"test",
"Node185":"test",
"Node186":"test",
"Node192":"test",
"Node193":"test",
"Node224":"test",
"Node248":"test",
"Node251":"test",
"Node252":"test",
"Node269":"test",
"Node285":"test",
"Node294":"test",
"Node295":"test",
"Node310":"test",
"Node316":"test",
"Node321":"test",
"Node322":"test",
"Node323":"test",
"Node330":"test",
"Node333":"test",
"Node336":"test",
"Node339":"test",
"Node34":"test",
"Node342":"test",
"Node345":"test",
"Node348":"test",
"Node351":"test",
"Node354":"test",
"Node357":"test",
"Node360":"test",
"Node400":"test",
"Node409":"test",
"Node410":"test",
"Node45":"test",
"Node454":"test",
"Node460":"test",
"Node71":"test",
"epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1":"test",
"epi_isl_402130_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_405839_Guangdong_20200111_null_1":"test",
"epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1":"test",
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_413559_California_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_413616_USA_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_414522_England_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_414619_USA_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1":"test",
"epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1":"test",
"epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1":"test",
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":"test",
"epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2":"test",
"epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":"test",
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_417391_New_South_Wales_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417438_Kinshasa_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_418046_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_418117_Wales_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418265_Athens_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418388_Finland_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_418417_ARA_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418750_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418769_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_418870_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418952_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419225_Hong_Kong_20200213_null_1":"test",
"epi_isl_419238_Basque_Country_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":"test",
"epi_isl_419244_Hong_Kong_20200222_null_1":"test",
"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_1":"test",
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":"test",
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_419400_Wales_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419709_BasqueCountry_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_419737_Victoria_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419832_Northern_Territory_20200221_null_2":"test",
"epi_isl_419856_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419881_Victoria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_420052_Ile_de_France_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_420172_South_Yorkshire_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_420210_South_Yorkshire_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420451_Mons_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_28":"test",
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420536_Western_Australia_20200315_null_2":"test",
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420590_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420628_Virginia_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_420676_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420701_England_20200327_null_9":"test",
"epi_isl_420720_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420742_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_420769_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_420775_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1":"test",
"epi_isl_420904_Munich_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_420915_Wales_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_421243_Jiangxi_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_421286_Wisconsin_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_421589_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421662_India_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_421666_India_20200310_null_4":"test",
"epi_isl_421807_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421831_England_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_421834_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421843_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421848_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421851_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421908_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422165_Wales_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422190_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_422311_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422345_Wales_20200324_null_5":"test",
"epi_isl_422354_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422541_New_York_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_422577_Netherlands_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422633_Zuid_Holland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422667_Netherlands_20200316_null_5":"test",
"epi_isl_422750_Netherlands_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422767_Netherlands_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422899_Utrecht_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_422939_Zuid_Holland_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_422952_Zuid_Holland_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423075_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423181_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423202_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423203_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423210_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423362_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423436_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423444_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423449_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423505_England_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_423509_England_20200331_null_6":"test",
"epi_isl_423558_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423559_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423610_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423675_England_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423701_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423702_England_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_423716_England_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_423719_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423757_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423770_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423784_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423791_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_423804_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423833_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423855_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_423863_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_423868_England_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_423900_England_20200318_null_6":"test",
"epi_isl_423906_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423917_England_20200318_null_7":"test",
"epi_isl_423952_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423969_England_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_423999_England_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_424000_England_20200321_null_3":"test",
"epi_isl_424001_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424025_England_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_424035_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_424060_England_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_424070_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424125_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_424131_England_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_424156_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424280_Washington_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424328_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_424332_Washington_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_15":"test",
"epi_isl_424579_Reykjavik_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_424613_Reykjavik_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_424641_Li_ge_20200403_null_3":"test",
"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_424943_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424982_Michigan_20200310_null_2":"test",
"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425199_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_425208_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_425259_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_425263_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_425291_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_425387_England_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_425504_England_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_425611_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_425615_England_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_425643_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425683_Scotland_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_4":"test",
"epi_isl_425755_Scotland_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_425764_Scotland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_425765_Scotland_20200313_null_4":"test",
"epi_isl_425767_Scotland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_425850_Scotland_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_425941_Scotland_20200326_null_3":"test",
"epi_isl_426044_New_York_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_426057_Idaho_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_426101_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426109_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426161_Wisconsin_20200406_null_4":"test",
"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_14":"test",
"epi_isl_426291_New_York_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_426421_Hawaii_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426569_Arizona_20200402_null_14":"test",
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_426661_Victoria_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_426673_Victoria_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_426682_Victoria_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_426699_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426718_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426770_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_426786_Victoria_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_426815_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_8":"test",
"epi_isl_426929_Victoria_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_426935_Victoria_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_427007_Victoria_20200329_null_6":"test",
"epi_isl_427029_Victoria_20200330_null_7":"test",
"epi_isl_427063_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_20":"test",
"epi_isl_427148_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427234_Washington_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_427265_Washington_20200331_null_13":"test",
"epi_isl_427286_Minnesota_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_427369_Liege_20200407_null_5":"test",
"epi_isl_427373_Liege_20200407_null_7":"test",
"epi_isl_427386_Liege_20200408_null_4":"test",
"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2":"test",
"epi_isl_427492_New_York_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_427570_New_York_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_427611_New_York_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_427621_Alaska_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_427629_New_York_20200330_null_6":"test",
"epi_isl_427635_New_York_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_427644_New_South_Wales_20200302_null_29":"test",
"epi_isl_427684_New_South_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_58":"test",
"epi_isl_427731_New_South_Wales_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_427774_New_South_Wales_20200322_null_1012":"test",
"epi_isl_427777_New_South_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_427806_New_South_Wales_20200326_null_164":"test",
"epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_428206_Nebraska_20200325_null_8229":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":8
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":8
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":16
}
}
}